RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609232.5

CTCFL-222, Transcript of CCCTC-binding factor like, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 3,668 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTCFL-222	ENST00000609232	METTL18	O95568	372 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	COPS2	P61201	443 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	PEX6	Q13608	980 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	BOLA3	Q53S33	107 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	LINGO4	Q6UY18	593 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	SEPT8	Q92599	483 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF570	Q96NI8	536 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	ZFAT	Q9P243	1243 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	CFLAR	O15519	480 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	GJB3	O75712	270 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	CCL5	P13501	91 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	GBP1	P32455	592 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	LAMB3	Q13751	1172 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	TFDP2	Q14188	446 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	DSC3	Q14574	896 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	PSMD5	Q16401	504 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	CYP1B1	Q16678	543 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	STK32A	Q8WU08	396 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	WDR70	Q9NW82	654 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	CDH9	Q9ULB4	789 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232		A8MUI8	341 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	TTC4	O95801	387 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	MPP2	Q14168	576 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	ACAP1	Q15027	740 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	PKDCC	Q504Y2	493 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	TTC13	Q8NBP0	860 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	PIGV	Q9NUD9	493 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	SEC16A	O15027	2179 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC12A8	A0AV02	714 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	SCAMP1	O15126	338 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	10.06	□□□□□ -0.8	3e-6	■■■□□ 16.8
CTCFL-222	ENST00000609232	DDHD2	O94830	711 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	ECHS1	P30084	290 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	NKX3-2	P78367	333 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	DBN1	Q16643	649 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	MARK4	Q96L34	752 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	PAFAH2	Q99487	392 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	TRIM4	Q9C037	500 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	CACNA1E	Q15878	2313 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	MFSD11	O43934	449 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	LPXN	O60711	386 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	GABBR2	O75899	941 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	CBX6	O95503	412 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	AMH	P03971	560 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	ERCC2	P18074	760 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	BGN	P21810	368 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	CASP2	P42575	452 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	POLE2	P56282	527 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	CTBP1	Q13363	440 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	ITIH4	Q14624	930 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	RMDN1	Q96DB5	314 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	HIPK3	Q9H422	1215 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	NT5M	Q9NPB1	228 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	TLR9	Q9NR96	1032 aa		10.06	□□□□□ -0.8

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