RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594693.5

ZNF548-204, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF548, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-204ENST00000594693 DMC1Q14565 340 aa18.14■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 PDK2Q15119 407 aa18.14■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF783Q6ZMS7 281 aa18.14■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 AHI1Q8N157 1196 aa18.14■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 KCTD6Q8NC69 237 aa18.14■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 RAPGEF5Q92565 580 aa18.14■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 LZTFL1Q9NQ48 299 aa18.14■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 NDFIP2Q9NV92 336 aa18.14■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 ELOVL2Q9NXB9 296 aa18.14■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 ILVBLA1L0T0 632 aa18.13■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 H3BRJ5 948 aa18.13■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 PSTPIP1O43586 416 aa18.13■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 PALMO75781 387 aa18.13■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 CD48P09326 243 aa18.13■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 ERCC2P18074 760 aa18.13■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 KDELR1P24390 212 aa18.13■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 ARL4AP40617 200 aa18.13■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 CSKP41240 450 aa18.13■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 MAGEA9P43362 315 aa18.13■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 KRT81Q14533 505 aa18.13■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 PLEKHG6Q3KR16 790 aa18.13■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 FUT11Q495W5 492 aa18.13■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 PITRM1Q5JRX3 1037 aa18.13■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 TMEM31Q5JXX7 168 aa18.13■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 MBLAC2Q68D91 279 aa18.13■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 MAMSTRQ6ZN01 415 aa18.13■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 NT5DC3Q86UY8 548 aa18.13■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 MAP7D3Q8IWC1 876 aa18.13■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 REXO1L1PQ8IX06 675 aa18.13■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 APCDD1Q8J025 514 aa18.13■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 SYCE1Q8N0S2 351 aa18.13■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 USP33Q8TEY7 942 aa18.13■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 CSPG4P5Q96PW8 444 aa18.13■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 CHRDQ9H2X0 955 aa18.13■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 DONSONQ9NYP3 566 aa18.13■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 CUL9Q8IWT3 2517 aa18.13■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa18.12■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 A0A0D9SEW6 157 aa18.12■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 DAPK3O43293 454 aa18.12■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 RNF40O75150 1001 aa18.12■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 RHOCP08134 193 aa18.12■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP18.12■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 GJC1P36383 396 aa18.12■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 DPYSL3Q14195 570 aa18.12■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 GAS6Q14393 721 aa18.12■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 VSIG1Q86XK7 387 aa18.12■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa18.12■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 TMEM105Q8N8V8 129 aa18.12■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa18.12■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 FAF2Q96CS3 445 aa18.12■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 KLC2Q9H0B6 622 aa18.12■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 DNAI1Q9UI46 699 aa18.12■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa18.12■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa18.12■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF487B1APH4 448 aa18.11■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa18.11■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 DCLK1O15075 740 aa18.11■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 ZSCAN12O43309 604 aa18.11■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 TNNT1P13805 278 aa18.11■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 AMPD1P23109 780 aa18.11■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 AVPR2P30518 371 aa18.11■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 PEX5P50542 639 aa18.11■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 SEC13P55735 322 aa18.11■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 GNA12Q03113 381 aa18.11■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 MMRN1Q13201 1228 aa18.11■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 C2orf27AQ580R0 203 aa18.11■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 Q6ZS52 159 aa18.11■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 UCMAQ8WVF2 138 aa18.11■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 SORCS1Q8WY21 1168 aa18.11■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 KRT35Q92764 455 aa18.11■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 PSMB7Q99436 277 aa18.11■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF670Q9BS34 389 aa18.11■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 IER2Q9BTL4 223 aa18.11■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 CIPCQ9C0C6 399 aa18.11■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 MAGEH1Q9H213 219 aa18.11■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 KLHL11Q9NVR0 708 aa18.11■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 AMFRQ9UKV5 643 aa18.11■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP18.11■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 LRRD1A4D1F6 860 aa18.1■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 NPC1O15118 1278 aa18.1■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 ATG13O75143 517 aa18.1■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 DLDP09622 509 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 CTNNA2P26232 953 aa18.1■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 TIE1P35590 1138 aa18.1■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 SULT2A1Q06520 285 aa18.1■□□□□ 0.49
ZNF548-204ENST00000594693 ENPP2Q13822 863 aa18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms