RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587928.5

ILF3-208, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 2

Gene ILF3, Length 4,230 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-208	ENST00000587928	HCRT	O43612	131 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	SBK3	P0C264	359 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	GLUD2	P49448	558 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	FKBP1B	P68106	108 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	CDC42EP1	Q00587	391 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	PPARD	Q03181	441 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	NUP93	Q8N1F7	819 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	C12orf29	Q8N999	325 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	APBB2	Q92870	758 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	C7orf26	Q96N11	449 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	ACAP3	Q96P50	834 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	SGK1	O00141	431 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	SPAG7	O75391	227 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	IL9R	Q01113	521 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	SLC6A3	Q01959	620 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	CCL15	Q16663	113 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	LRRC39	Q96DD0	335 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	NPY6R	Q99463	290 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	NOTO	A8MTQ0	251 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	AP3B1	O00203	1094 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	PTGES	O14684	152 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	LYN	P07948	512 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	TPBGL	P0DKB5	382 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	KRT81	Q14533	505 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	APOPT1	Q96IL0	206 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	CPB2	Q96IY4	423 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	ZNF333	Q96JL9	665 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	SORT1	Q99523	831 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	TRABD	Q9H4I3	376 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	SAR1A	Q9NR31	198 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	OSER1	Q9NX31	292 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928		M0QZ92	97 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	TRPA1	O75762	1119 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	CSH1	P0DML2	217 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	CSH2	P0DML3	217 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	GTF2A2	P52657	109 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	RBP5	P82980	135 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	NR1D2	Q14995	579 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	CYTH1	Q15438	398 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	HIF1A	Q16665	826 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	MPP5	Q8N3R9	675 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	TERB1	Q8NA31	727 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	KCTD6	Q8NC69	237 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	HAPLN3	Q96S86	360 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	GIN1	Q9NXP7	522 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	REV3L	O60673	3130 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	CAPN9	O14815	690 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	GPD1	P21695	349 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	RFX6	Q8HWS3	928 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	CCNJL	Q8IV13	435 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	HACE1	Q8IYU2	909 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	GIPC3	Q8TF64	312 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	DTL	Q9NZJ0	730 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	GSTT2	P0CG29	244 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	GSTT2B	P0CG30	244 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	CYP2C9	P11712	490 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	MLN	P12872	115 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	ADORA2A	P29274	412 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	AP1B1	Q10567	949 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		11.15	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms