RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 NUB1Q9Y5A7 615 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 FN1P02751 2386 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 TMEM150BA6NC51 233 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 RRN3P2A6NIE6 340 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 TM9SF1O15321 606 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 RRP8O43159 456 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 TGM5O43548 720 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 GJB3O75712 270 aa8.33□□□□□ -1.08
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GGA3-218ENST00000584243 GALTP07902 379 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 ATP4AP20648 1035 aa8.33□□□□□ -1.08
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GGA3-218ENST00000584243 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
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GGA3-218ENST00000584243 CNGA2Q16280 664 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 TAZQ16635 292 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 DBN1Q16643 649 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 HIF1AQ16665 826 aa8.33□□□□□ -1.08
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GGA3-218ENST00000584243 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 ZNF787Q6DD87 383 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 LILRA6Q6PI73 481 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 TAS1R1Q7RTX1 841 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 PIGWQ7Z7B1 504 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 UNC93AQ86WB7 457 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 CCDC25Q86WR0 208 aa8.33□□□□□ -1.08
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GGA3-218ENST00000584243 HDDC3Q8N4P3 179 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 LRRC52Q8N7C0 313 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 FBF1Q8TES7 1133 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 TEKT4Q8WW24 435 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 ING5Q8WYH8 240 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 SMC6Q96SB8 1091 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 BRD9Q9H8M2 597 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 KLHL14Q9P2G3 628 aa8.33□□□□□ -1.08
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GGA3-218ENST00000584243 TLDC2A0PJX2 215 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 CCT8L1PA6NM43 557 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 DPYSL4O14531 572 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 CHUKO15111 745 aa8.32□□□□□ -1.08
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GGA3-218ENST00000584243 ADH1AP07327 375 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 VIMP08670 466 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 DRD4P21917 467 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 TGM2P21980 687 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 FGFR4P22455 802 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 PSMA2P25787 234 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 STX2P32856 288 aa8.32□□□□□ -1.08
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GGA3-218ENST00000584243 SLC11A1P49279 550 aa8.32□□□□□ -1.08
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GGA3-218ENST00000584243 SP4Q02446 784 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 IFT88Q13099 833 aa8.32□□□□□ -1.08
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GGA3-218ENST00000584243 SPARCL1Q14515 664 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 DGKKQ5KSL6 1271 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 ARHGAP40Q5TG30 622 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 FYB2Q5VWT5 728 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 SLC23A3Q6PIS1 610 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 CCNJLQ8IV13 435 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 CCDC13Q8IYE1 715 aa8.32□□□□□ -1.08
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