RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564123.6

BBS2-208, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, humanhuman

TSL 3

Gene BBS2, Length 395 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2-208ENST00000564123 WDR17Q8IZU2 1322 aa3.61□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 LMTK3Q96Q04 1460 aa3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 CXorf65A6NEN9 183 aa3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 MCIDASD6RGH6 385 aa3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 SH3BP5O60239 455 aa3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 TSPAN3O60637 253 aa3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 WEE2P0C1S8 567 aa3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 CYP4B1P13584 511 aa3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 PKMP14618 531 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 RPS6KB1P23443 525 aa3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 LIFRP42702 1097 aa3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 ADPRHP54922 357 aa3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 TLE2Q04725 743 aa3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 GOLGA8FQ08AF8 430 aa3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 AP5B1Q2VPB7 878 aa3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 LIPMQ5VYY2 423 aa3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 MTFR2Q6P444 385 aa3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 BBS12Q6ZW61 710 aa3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 RTL10Q7L3V2 364 aa3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 ADGRF4Q8IZF3 695 aa3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 USP38Q8NB14 1042 aa3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 OR52N4Q8NGI2 321 aa3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 C2CD4CQ8TF44 421 aa3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 ZFPM2Q8WW38 1151 aa3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 HTRA1Q92743 480 aa3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 MROH8Q9H579 483 aa3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 TMEM160Q9NX00 188 aa3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 GJD2Q9UKL4 321 aa3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 HSF4Q9ULV5 492 aa3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 SUFUQ9UMX1 484 aa3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa3.6□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 WIPF3A6NGB9 483 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 C2CD4BA6NLJ0 364 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 PPP6CO00743 305 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 MSI1O43347 362 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 NFATC1O95644 943 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 TNNT1P13805 278 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 ARSAP15289 507 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 TFEBP19484 476 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 PRKCHP24723 683 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 EPHB2P29323 1055 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 TYK2P29597 1187 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 PGM1P36871 562 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 ABCG1P45844 678 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 TUBP50607 506 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 RPS6KA3P51812 740 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 OAZ1P54368 228 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 SLC12A2P55011 1212 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 ARHGAP8P85298 464 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 NHLH1Q02575 133 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 FOXF2Q12947 444 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 MAPK7Q13164 816 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 GALNT3Q14435 633 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 C10orf76Q5T2E6 689 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 ANO7Q6IWH7 933 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 DENND1BQ6P3S1 775 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 KLBQ86Z14 1044 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 BRSK2Q8IWQ3 736 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 EXD3Q8N9H8 876 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 ZNF398Q8TD17 642 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 HVCN1Q96D96 273 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 RNFT2Q96EX2 444 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 P2RY11Q96G91 374 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 MASTLQ96GX5 879 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 FAM118BQ9BPY3 351 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 ERVK-5Q9HDB9 667 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 WASH6PQ9NQA3 447 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 SLC22A11Q9NSA0 550 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 UPB1Q9UBR1 384 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 TNFSF13BQ9Y275 285 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
BBS2-208ENST00000564123 A0A1B0GVC2 190 aa3.58□□□□□ -1.84
BBS2-208ENST00000564123 A6NLC8 198 aa3.58□□□□□ -1.84
BBS2-208ENST00000564123 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
BBS2-208ENST00000564123 USP12O75317 370 aa3.58□□□□□ -1.84
BBS2-208ENST00000564123 SGPL1O95470 568 aa3.58□□□□□ -1.84
BBS2-208ENST00000564123 METTL18O95568 372 aa3.58□□□□□ -1.84
BBS2-208ENST00000564123 LATS1O95835 1130 aa3.58□□□□□ -1.84
BBS2-208ENST00000564123 TUBB4AP04350 444 aa3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms