RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557975.5

ETFA-204, Transcript of electron transfer flavoprotein subunit alpha, human

TSL 3

Gene ETFA, Length 1,086 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ETFA-204	ENST00000557975	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ETFA-204	ENST00000557975	TTC22	Q5TAA0	569 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ETFA-204	ENST00000557975	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ETFA-204	ENST00000557975	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ETFA-204	ENST00000557975	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ETFA-204	ENST00000557975	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ETFA-204	ENST00000557975	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ETFA-204	ENST00000557975	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ETFA-204	ENST00000557975	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ETFA-204	ENST00000557975	DAPP1	Q9UN19	280 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ETFA-204	ENST00000557975	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ETFA-204	ENST00000557975		A6NNC1	897 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-204	ENST00000557975	POLD2	P49005	469 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-204	ENST00000557975	LINC00205	P59089	165 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-204	ENST00000557975	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-204	ENST00000557975	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-204	ENST00000557975	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-204	ENST00000557975	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-204	ENST00000557975	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-204	ENST00000557975	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-204	ENST00000557975	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-204	ENST00000557975	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-204	ENST00000557975	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-204	ENST00000557975	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-204	ENST00000557975	KAT2A	Q92830	837 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-204	ENST00000557975	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-204	ENST00000557975	NPAS1	Q99742	590 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-204	ENST00000557975	ARL15	Q9NXU5	204 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-204	ENST00000557975	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-204	ENST00000557975	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-204	ENST00000557975	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ETFA-204	ENST00000557975	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	MDM4	O15151	490 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	ATG13	O75143	517 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	NEURL1	O76050	574 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	IFNA2	P01563	188 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	GSTM2	P28161	218 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	TRIM14	Q14142	442 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	GALNTL6	Q49A17	601 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	RTL10	Q7L3V2	364 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	CCDC25	Q86WR0	208 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	DPP10	Q8N608	796 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	EXD3	Q8N9H8	876 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	IP6K1	Q92551	441 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	RUBCN	Q92622	972 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	RNF146	Q9NTX7	359 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	PKP3	Q9Y446	797 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	TMEM247	A6NEH6	219 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	HMX3	A6NHT5	357 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975		H0YGN5	161 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	GRM8	O00222	908 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	HLA-DQA2	P01906	255 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	KLKB1	P03952	638 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	SLC16A2	P36021	539 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	CYP2J2	P51589	502 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	PGGT1B	P53609	377 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	P2RX3	P56373	397 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	RHAG	Q02094	409 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	CDK18	Q07002	472 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	FOXO1	Q12778	655 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	LIN54	Q6MZP7	749 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	AAGAB	Q6PD74	315 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	PARM1	Q6UWI2	310 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	RRAGA	Q7L523	313 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	KCNJ9	Q92806	393 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	ARRDC3	Q96B67	414 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	ALPL	P05186	524 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	FGF2	P09038	288 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	KLRC2	P26717	231 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	MCM2	P49736	904 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	RGS19	P49795	217 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ETFA-204	ENST00000557975	HTR6	P50406	440 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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