RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553628.1

AC009396.1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AC009396.1, Length 1,079 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC009396.1-201ENST00000553628 TMEM65Q6PI78 240 aa6.05□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 C8orf58Q8NAV2 365 aa6.05□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa6.05□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 NUDT22Q9BRQ3 303 aa6.05□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 CRB3Q9BUF7 120 aa6.05□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 PLCB1Q9NQ66 1216 aa6.05□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa6.05□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 SNED1Q8TER0 1413 aa6.05□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 COL4A1P02462 1669 aa6.04□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 LAMB2P55268 1798 aa6.04□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 ALPK3Q96L96 1907 aa6.04□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 H0YGN5 161 aa6.04□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 UBE2Q2LH0YL09 131 aa6.04□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 FYB1O15117 783 aa6.04□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 USP1O94782 785 aa6.04□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 MAP2K2P36507 400 aa6.04□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 TNFAIP2Q03169 654 aa6.04□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 CCDC15Q0P6D6 951 aa6.04□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 FOXF2Q12947 444 aa6.04□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 BFSP2Q13515 415 aa6.04□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 KCNB1Q14721 858 aa6.04□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 CCDC142Q17RM4 750 aa6.04□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 MOB2Q70IA6 237 aa6.04□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 RASGRP3Q8IV61 690 aa6.04□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 CCDC17Q96LX7 622 aa6.04□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 SIN3AQ96ST3 1273 aa6.04□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 FLRT1Q9NZU1 646 aa6.04□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 SEMA5BQ9P283 1151 aa6.04□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 NARFQ9UHQ1 456 aa6.04□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 LRCH1Q9Y2L9 728 aa6.04□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa6.03□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 M0QZQ0 153 aa6.03□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 CLIC1O00299 241 aa6.03□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 ASNA1O43681 348 aa6.03□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 TAF5LO75529 589 aa6.03□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 NTSR2O95665 410 aa6.03□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 GLP2RO95838 553 aa6.03□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 CYP2D6P10635 497 aa6.03□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 NPPBP16860 134 aa6.03□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 MORC3Q14149 939 aa6.03□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 SEC23BQ15437 767 aa6.03□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 CEP78Q5JTW2 689 aa6.03□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa6.03□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 MSANTD2Q6P1R3 559 aa6.03□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 FAM71DQ8N9W8 422 aa6.03□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 VPS37AQ8NEZ2 397 aa6.03□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 STYXQ8WUJ0 223 aa6.03□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 C5orf34Q96MH7 638 aa6.03□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 HS6ST2Q96MM7 605 aa6.03□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 EPS8L2Q9H6S3 715 aa6.03□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 OBP2BQ9NPH6 170 aa6.03□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 HELLSQ9NRZ9 838 aa6.03□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 RXFP3Q9NSD7 469 aa6.03□□□□□ -1.44
AC009396.1-201ENST00000553628 SCN9AQ15858 1988 aa6.02□□□□□ -1.45
AC009396.1-201ENST00000553628 CCDC187A0A096LP49 1063 aa6.02□□□□□ -1.45
AC009396.1-201ENST00000553628 GXYLT2A0PJZ3 443 aa6.02□□□□□ -1.45
AC009396.1-201ENST00000553628 NPC1O15118 1278 aa6.02□□□□□ -1.45
AC009396.1-201ENST00000553628 FFAR2O15552 330 aa6.02□□□□□ -1.45
AC009396.1-201ENST00000553628 CTIFO43310 598 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
AC009396.1-201ENST00000553628 ITGA5P08648 1049 aa6.02□□□□□ -1.45
AC009396.1-201ENST00000553628 ALADP13716 330 aa6.02□□□□□ -1.45
AC009396.1-201ENST00000553628 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
AC009396.1-201ENST00000553628 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
AC009396.1-201ENST00000553628 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
AC009396.1-201ENST00000553628 SLC14A1Q13336 389 aa6.02□□□□□ -1.45
AC009396.1-201ENST00000553628 GRM4Q14833 912 aa6.02□□□□□ -1.45
AC009396.1-201ENST00000553628 C1orf228Q6PIY5 440 aa6.02□□□□□ -1.45
AC009396.1-201ENST00000553628 Q7L0L9 218 aa6.02□□□□□ -1.45
AC009396.1-201ENST00000553628 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
AC009396.1-201ENST00000553628 OVCA2Q8WZ82 227 aa6.02□□□□□ -1.45
AC009396.1-201ENST00000553628 GCC1Q96CN9 775 aa6.02□□□□□ -1.45
AC009396.1-201ENST00000553628 SH2D3AQ9BRG2 576 aa6.02□□□□□ -1.45
AC009396.1-201ENST00000553628 PDGFCQ9NRA1 345 aa6.02□□□□□ -1.45
AC009396.1-201ENST00000553628 ABHD10Q9NUJ1 306 aa6.02□□□□□ -1.45
AC009396.1-201ENST00000553628 VPS4AQ9UN37 437 aa6.02□□□□□ -1.45
AC009396.1-201ENST00000553628 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
AC009396.1-201ENST00000553628 ABCC12Q96J65 1359 aa6.02□□□□□ -1.45
AC009396.1-201ENST00000553628 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
AC009396.1-201ENST00000553628 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa6.01□□□□□ -1.45
AC009396.1-201ENST00000553628 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
AC009396.1-201ENST00000553628 LGALS16A8MUM7 142 aa6.01□□□□□ -1.45
AC009396.1-201ENST00000553628 TMEM232C9JQI7 657 aa6.01□□□□□ -1.45
AC009396.1-201ENST00000553628 TNFRSF6BO95407 300 aa6.01□□□□□ -1.45
AC009396.1-201ENST00000553628 ANXA6P08133 673 aa6.01□□□□□ -1.45
AC009396.1-201ENST00000553628 CELA2AP08217 269 aa6.01□□□□□ -1.45
AC009396.1-201ENST00000553628 KLRK1P26718 216 aa6.01□□□□□ -1.45
AC009396.1-201ENST00000553628 EPHB2P29323 1055 aa6.01□□□□□ -1.45
AC009396.1-201ENST00000553628 MPGP29372 298 aa6.01□□□□□ -1.45
AC009396.1-201ENST00000553628 GSTM5P46439 218 aa6.01□□□□□ -1.45
AC009396.1-201ENST00000553628 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms