RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553406.1

DDHD1-204, Transcript of DDHD domain containing 1, human

TSL 3

Gene DDHD1, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDHD1-204	ENST00000553406	SEC23B	Q15437	767 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDHD1-204	ENST00000553406	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDHD1-204	ENST00000553406	KSR2	Q6VAB6	950 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDHD1-204	ENST00000553406	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDHD1-204	ENST00000553406	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DDHD1-204	ENST00000553406	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
DDHD1-204	ENST00000553406	SNX22	Q96L94	193 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDHD1-204	ENST00000553406	FAM227B	Q96M60	508 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDHD1-204	ENST00000553406	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DDHD1-204	ENST00000553406	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DDHD1-204	ENST00000553406	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDHD1-204	ENST00000553406	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDHD1-204	ENST00000553406	PTPRC	P08575	1304 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDHD1-204	ENST00000553406	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DDHD1-204	ENST00000553406	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDHD1-204	ENST00000553406	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	ADAM10	O14672	748 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	IKBKB	O14920	756 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	CLGN	O14967	610 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	TLR2	O60603	784 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	TPM2	P07951	284 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	YY1	P25490	414 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	TACR3	P29371	465 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	GPC5	P78333	572 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	KRT78	Q8N1N4	520 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	NRAC	Q8N912	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	LINS1	Q8NG48	757 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	PSMD1	Q99460	953 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	WAC	Q9BTA9	647 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	HPSE	Q9Y251	543 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	UTY	O14607	1347 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	ABCC4	O15439	1325 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	KIF16B	Q96L93	1317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	LAMB1	P07942	1786 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	MYMK	A6NI61	221 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	TRIM38	O00635	465 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	NPHP1	O15259	732 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	INSIG1	O15503	277 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	PRF1	P14222	555 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	ALDH1B1	P30837	517 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	NTSR1	P30989	418 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	HTR7	P34969	479 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	PRELP	P51888	382 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	SLC14A1	Q13336	389 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	GCKR	Q14397	625 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	KCNAB1	Q14722	419 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	G2E3	Q7L622	706 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	PIP4P1	Q86T03	277 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	USP29	Q9HBJ7	922 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	OBP2A	Q9NY56	170 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	CTSA	P10619	480 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	MCC	P23508	829 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	ZNF91	Q05481	1191 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	GRAP	Q13588	217 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	DNASE1L3	Q13609	305 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	BEND3	Q5T5X7	828 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	RNF44	Q7L0R7	432 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	TTC8	Q8TAM2	541 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	MYD88	Q99836	296 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	VPS33B	Q9H267	617 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	GRM8	O00222	908 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDHD1-204	ENST00000553406	BBOX1	O75936	387 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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