RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 NPIPA7E9PJI5 369 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 H0YJX3 145 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TNFAIP8O95379 198 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TGDSO95455 350 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 NPIPA8P0DM63 369 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ITIH1P19827 911 aa6.43□□□□□ -1.38
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PTPRB-210ENST00000551525 TMIEQ8NEW7 156 aa6.43□□□□□ -1.38
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PTPRB-210ENST00000551525 SH3D19Q5HYK7 790 aa6.43□□□□□ -1.38
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PTPRB-210ENST00000551525 BNIPLQ7Z465 357 aa6.43□□□□□ -1.38
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PTPRB-210ENST00000551525 LINC00301Q8NCQ3 95 aa6.43□□□□□ -1.38
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PTPRB-210ENST00000551525 SIRT2Q8IXJ6 389 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 COLGALT2Q8IYK4 626 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 OR52K2Q8NGK3 314 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 E2F7Q96AV8 911 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 EBF2Q9HAK2 575 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PLA2G4CQ9UP65 541 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PDZK1P1A8MUH7 402 aa6.42□□□□□ -1.38
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