RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-223ENST00000551137 APCDD1Q8J025 514 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 ZNF366Q8N895 744 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 NEK11Q8NG66 645 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 SLC20A1Q8WUM9 679 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 PTPRN2Q92932 1015 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 HAPLN3Q96S86 360 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 TKTL2Q9H0I9 626 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 RETREG1Q9H6L5 497 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 SGK2Q9HBY8 427 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 NLRC4Q9NPP4 1024 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 ANLNQ9NQW6 1124 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 COX16Q9P0S2 106 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 VANGL2Q9ULK5 521 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 MYO6Q9UM54 1294 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 A0A1B0GTW7 788 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 TTC34A8MYJ7 566 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 ATP9BO43861 1147 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 SIN3BO75182 1162 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 GJB3O75712 270 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 CFIP05156 583 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 SYPP08247 313 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 ATP1A3P13637 1013 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 CEACAM1P13688 526 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 PDGFRAP16234 1089 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 ACSL1P33121 698 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 NNMTP40261 264 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 PTPN9P43378 593 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 SULT1E1P49888 294 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 IRAK1P51617 712 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 DEUP1Q05D60 604 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 SEMA3BQ13214 749 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 SLC14A1Q13336 389 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 C2CD6Q53TS8 623 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 C14orf80Q86SX3 495 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 PIP4P1Q86T03 277 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 FRS2Q8WU20 508 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 FAM131CQ96AQ9 280 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 PCDHB18PQ96TA0 734 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 FAM129BQ96TA1 746 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 BTBD1Q9H0C5 482 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 FZD4Q9ULV1 537 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 DOCK4Q8N1I0 1966 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 C2CD4BA6NLJ0 364 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 MEI4A8MW99 385 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 SEMA4FO95754 770 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 CCDC172P0C7W6 258 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 RDXP35241 583 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 SHC2P98077 582 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 CST6Q15828 149 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 ANO6Q4KMQ2 910 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 DCAF12L1Q5VU92 463 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 ZNF783Q6ZMS7 281 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 RGL4Q8IZJ4 473 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 AOPEPQ8N6M6 819 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 OR52K2Q8NGK3 314 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 SYT11Q9BT88 431 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 FUCA2Q9BTY2 467 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 SIK2Q9H0K1 926 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 MTG2Q9H4K7 406 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 ZNF212Q9UDV6 495 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 HS3ST2Q9Y278 367 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 SIGLEC16A6NMB1 481 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 SMTNL1A8MU46 457 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 GOLGA8SH3BPF8 625 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 ALOX15BO15296 676 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 CNTN5O94779 1100 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 ADH1BP00325 375 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 CALB1P05937 261 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-223ENST00000551137 ZNF883P0CG24 379 aa11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms