RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550658.1

SYF2P1-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SYF2P1, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2P1-201ENST00000550658 RAB32Q13637 225 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 CAPSQ13938 189 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 CBFBQ13951 182 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 ARHGEF6Q15052 776 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 RPS6KA2Q15349 733 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 MEP1BQ16820 701 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF628Q5EBL2 1059 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 FBXO48Q5FWF7 155 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 TCTE1Q5JU00 501 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 COLEC12Q5KU26 742 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 MPP7Q5T2T1 576 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 SHEQ5VZ18 495 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC25A24Q6NUK1 477 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 TRAT1Q6PIZ9 186 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 ZYG11AQ6WRX3 759 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 UNC13DQ70J99 1090 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 ATG9AQ7Z3C6 839 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 OSTM1Q86WC4 334 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 CEP57Q86XR8 500 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 DENND6AQ8IWF6 608 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 ZFPM1Q8IX07 1006 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 CDH26Q8IXH8 852 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 YAF2Q8IY57 180 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 SYCP3Q8IZU3 236 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 NLGN4XQ8N0W4 816 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 CNTROBQ8N137 903 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 KRT222Q8N1A0 295 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 ARL14Q8N4G2 192 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM133AQ8N9E0 248 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 POC5Q8NA72 575 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC4A11Q8NBS3 891 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 MDM1Q8TC05 714 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 URGCPQ8TCY9 931 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 BCAS4Q8TDM0 211 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 TEKT4Q8WW24 435 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 CPT1BQ92523 772 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 THRSPQ92748 146 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 MBD6Q96DN6 1003 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 SAAL1Q96ER3 474 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 C8orf76Q96K31 380 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 GCNAQ96QF7 691 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 GAL3ST4Q96RP7 486 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM209Q96SK2 561 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 SH3GL1Q99961 368 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 FERMT1Q9BQL6 677 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 PACSIN1Q9BY11 444 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 NFKBIZQ9BYH8 718 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 OSBPL6Q9BZF3 934 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 KLHL4Q9C0H6 718 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM168Q9H0V1 697 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 WNT5BQ9H1J7 359 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 ISCUQ9H1K1 167 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 EPB41L1Q9H4G0 881 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 WDCPQ9H6R7 721 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 SH2D4AQ9H788 454 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 DNAJC18Q9H819 358 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 SMURF1Q9HCE7 757 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 G6PC2Q9NQR9 355 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 GLRX2Q9NS18 164 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 HOMER3Q9NSC5 361 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 GDAP2Q9NXN4 497 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 STK32BQ9NY57 414 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 MYOTQ9UBF9 498 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 TUBE1Q9UJT0 475 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 APPL1Q9UKG1 709 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 CROTQ9UKG9 612 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 PSME2Q9UL46 239 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 HSF4Q9ULV5 492 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 CLEC4AQ9UMR7 237 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 SUFUQ9UMX1 484 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 CLDN16Q9Y5I7 305 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 NUMBLQ9Y6R0 609 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 PRSS38A1L453 326 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 VWA3AA6NCI4 1184 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 LIPT2A6NK58 231 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 SCDO00767 359 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 RASGRF2O14827 1237 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 KLK10O43240 276 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2P1-201ENST00000550658 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms