RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548620.1

USP15-209, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 3

Gene USP15, Length 816 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-209ENST00000548620 MSI1O43347 362 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
USP15-209ENST00000548620 NTN1O95631 604 aa5.78□□□□□ -1.48
USP15-209ENST00000548620 CHRNB1P11230 501 aa5.78□□□□□ -1.48
USP15-209ENST00000548620 PRKAA2P54646 552 aa5.78□□□□□ -1.48
USP15-209ENST00000548620 LINC00205P59089 165 aa5.78□□□□□ -1.48
USP15-209ENST00000548620 RHAGQ02094 409 aa5.78□□□□□ -1.48
USP15-209ENST00000548620 ZBTB16Q05516 673 aa5.78□□□□□ -1.48
USP15-209ENST00000548620 CDK18Q07002 472 aa5.78□□□□□ -1.48
USP15-209ENST00000548620 GALNT3Q14435 633 aa5.78□□□□□ -1.48
USP15-209ENST00000548620 TIGD6Q17RP2 521 aa5.78□□□□□ -1.48
USP15-209ENST00000548620 TTC39AQ5SRH9 613 aa5.78□□□□□ -1.48
USP15-209ENST00000548620 MANEAQ5SRI9 462 aa5.78□□□□□ -1.48
USP15-209ENST00000548620 RFX8Q6ZV50 586 aa5.78□□□□□ -1.48
USP15-209ENST00000548620 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa5.78□□□□□ -1.48
USP15-209ENST00000548620 PIM3Q86V86 326 aa5.78□□□□□ -1.48
USP15-209ENST00000548620 TMEM200AQ86VY9 491 aa5.78□□□□□ -1.48
USP15-209ENST00000548620 MYCT1Q8N699 235 aa5.78□□□□□ -1.48
USP15-209ENST00000548620 C9orf106Q8NAJ2 232 aa5.78□□□□□ -1.48
USP15-209ENST00000548620 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
USP15-209ENST00000548620 SLC25A28Q96A46 364 aa5.78□□□□□ -1.48
USP15-209ENST00000548620 ARRDC3Q96B67 414 aa5.78□□□□□ -1.48
USP15-209ENST00000548620 NLRP4Q96MN2 994 aa5.78□□□□□ -1.48
USP15-209ENST00000548620 HDHD5Q9BXW7 423 aa5.78□□□□□ -1.48
USP15-209ENST00000548620 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
USP15-209ENST00000548620 NPIPB13A6NJU9 1138 aa5.77□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 NPIPB5A8MRT5 1133 aa5.77□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 NPIPB4C9JG80 1138 aa5.77□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 PEX14O75381 377 aa5.77□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 KRTAP1-1Q07627 177 aa5.77□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 PDCLQ13371 301 aa5.77□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 SEMA3AQ14563 771 aa5.77□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 NUGGCQ68CJ6 796 aa5.77□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 SLC30A9Q6PML9 568 aa5.77□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa5.77□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 KLBQ86Z14 1044 aa5.77□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 OR6Y1Q8NGX8 325 aa5.77□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa5.77□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 ARPC5LQ9BPX5 153 aa5.77□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 PTPRHQ9HD43 1115 aa5.77□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 G6PC2Q9NQR9 355 aa5.77□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 TMLHEQ9NVH6 421 aa5.77□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 ARL15Q9NXU5 204 aa5.77□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 BAG5Q9UL15 447 aa5.77□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa5.77□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 CKAP5Q14008 2032 aa5.77□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 MYMKA6NI61 221 aa5.76□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 B4DGG1 531 aa5.76□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 H3BNX3 289 aa5.76□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 FAM155BO75949 473 aa5.76□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 STAT1P42224 750 aa5.76□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 GAD2Q05329 585 aa5.76□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 PMPCAQ10713 525 aa5.76□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 POSTNQ15063 836 aa5.76□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 GPR162Q16538 588 aa5.76□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 ODF3L2Q3SX64 289 aa5.76□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 LRRC24Q50LG9 513 aa5.76□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 SYT13Q7L8C5 426 aa5.76□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 KDELC2Q7Z4H8 507 aa5.76□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa5.76□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 FAM234AQ9H0X4 552 aa5.76□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 SAYSD1Q9NPB0 183 aa5.76□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 SQORQ9Y6N5 450 aa5.76□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa5.75□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 FAM90A10PA6NDY2 464 aa5.75□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 E7EVH7 732 aa5.75□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.494e-7■□□□□ 9.7
USP15-209ENST00000548620 LCKP06239 509 aa5.75□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 LYL1P12980 280 aa5.75□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 CHN1P15882 459 aa5.75□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 HMBOX1Q6NT76 420 aa5.75□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 MTFR2Q6P444 385 aa5.75□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa5.75□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 GPSM1Q86YR5 675 aa5.75□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 GALNT15Q8N3T1 639 aa5.75□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 TMEM217Q8N7C4 229 aa5.75□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 TMEM174Q8WUU8 243 aa5.75□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 ZNF304Q9HCX3 659 aa5.75□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 Q9N2J8 555 aa5.75□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 FZD3Q9NPG1 666 aa5.75□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 TMEM248Q9NWD8 314 aa5.75□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 ANAPC4Q9UJX5 808 aa5.75□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa5.74□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 CD8B2A6NJW9 211 aa5.74□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 TCEA3O75764 348 aa5.74□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 KRT38O76015 456 aa5.74□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 SYF2O95926 243 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 CRYABP02511 175 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 ACP5P13686 325 aa5.74□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 PKMP14618 531 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 SCP2P22307 547 aa5.74□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 CHRNA5P30532 468 aa5.74□□□□□ -1.49
USP15-209ENST00000548620 GRK6P43250 576 aa5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms