RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 GFPT2O94808 682 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 GGPS1O95749 300 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 PIGRP01833 764 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 KRT13P13646 458 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 MTHFD2P13995 350 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 PRLRP16471 622 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 FERP16591 822 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 XPAP23025 273 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 ANXA13P27216 316 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 MTNR1BP49286 362 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 RAB27AP51159 221 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 EPHB1P54762 984 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 MCL1Q07820 350 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 SPIDRQ14159 915 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 KCTD2Q14681 263 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 EMC2Q15006 297 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 C10orf76Q5T2E6 689 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 TAPT1Q6NXT6 567 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 METTL7BQ6UX53 244 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 DNAAF5Q86Y56 855 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 ARHGEF19Q8IW93 802 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 PARD3BQ8TEW8 1205 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 TSPEARQ8WU66 669 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 BRI3BPQ8WY22 251 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 JADE3Q92613 823 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 RABGGTAQ92696 567 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 SEMA4DQ92854 862 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 KAT5Q92993 513 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 CLIP3Q96DZ5 547 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 SAAL1Q96ER3 474 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 WDR92Q96MX6 357 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 SPAG5Q96R06 1193 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 MMS19Q96T76 1030 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 TLR10Q9BXR5 811 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 PARD6BQ9BYG5 372 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 SLC13A1Q9BZW2 595 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 HAPLN2Q9GZV7 340 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 MROH8Q9H579 483 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 IFT122Q9HBG6 1241 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 PDGFCQ9NRA1 345 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 ZNF446Q9NWS9 450 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 COQ4Q9Y3A0 265 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 JRKLQ9Y4A0 524 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 SAR1BQ9Y6B6 198 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 CDY2AQ9Y6F7 541 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 RLFQ13129 1914 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 F8VZ95 297 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 PDHXO00330 501 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 ZNF185O15231 689 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 NCK2O43639 380 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 BUB1O43683 1085 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 EDN1P05305 212 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 CETPP11597 493 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 MAKP20794 623 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 AGXTP21549 392 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 GTF2H1P32780 548 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 NAMPTP43490 491 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 GPR15P49685 360 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 GPC3P51654 580 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 MYL7Q01449 175 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 ENPEPQ07075 957 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 CD69Q07108 199 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 CYP24A1Q07973 514 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 DRP2Q13474 957 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 KIF22Q14807 665 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 PLCB4Q15147 1175 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 HSDL1Q3SXM5 330 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 TEX35Q5T0J7 233 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 FAM160B1Q5W0V3 765 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 KCNV1Q6PIU1 500 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 PCSK4Q6UW60 755 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 Q6ZPA2 131 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 ANKRD23Q86SG2 305 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 ZNF575Q86XF7 245 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms