RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543470.5

RPS6KC1-207, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RPS6KC1, Length 4,227 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-207ENST00000543470 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.055e-6■■■■□ 25.5
RPS6KC1-207ENST00000543470 H3BRB1 525 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 TRIM13O60858 407 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 MICAL2O94851 1124 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 VAPBO95292 243 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 AKAP5P24588 427 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 SERPINB10P48595 397 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 TMED10P49755 219 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 CDC16Q13042 620 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 HPS6Q86YV9 775 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 MRIQ9BWK5 157 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 SLC38A7Q9NVC3 462 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 MYO9BQ13459 2157 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 VWA5AO00534 786 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 ERBB2P04626 1255 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 RAB27AP51159 221 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 TKTL1P51854 596 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 TAS1R3Q7RTX0 852 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 UNC5BQ8IZJ1 945 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 PANX3Q96QZ0 392 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 FICDQ9BVA6 458 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 PORCNQ9H237 461 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 ETNK2Q9NVF9 386 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 SNTG2Q9NY99 539 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 YDJCA8MPS7 323 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 ABLIM1O14639 778 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 MAP3K13O43283 966 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 PEX1O43933 1283 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 PEX10O60683 326 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 SERPINE1P05121 402 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 F7P08709 466 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 RGS4P49798 205 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 PWP1Q13610 501 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 CAPSQ13938 189 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 KRT72Q14CN4 511 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 MRNIPQ6NTE8 343 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 DHDDSQ86SQ9 333 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 SNX32Q86XE0 403 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 NDNQ99608 321 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 SEPHS2Q99611 448 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 RIC8BQ9NVN3 520 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 CCDC167Q9P0B6 97 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 AK5Q9Y6K8 562 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 ZNF536O15090 1300 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 A0A1B0GVG6 124 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 USP4Q13107 963 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 SNAPC2Q13487 334 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 CCL15Q16663 113 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 TJAP1Q5JTD0 557 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 FBXO47Q5MNV8 452 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 METTL7BQ6UX53 244 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 TNS4Q8IZW8 715 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 HTR3CQ8WXA8 447 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 GPRC5DQ9NZD1 345 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 KANSL3Q9P2N6 904 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 RREB1Q92766 1687 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 PEX2P28328 305 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 PNPLA4P41247 253 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 NAGLUP54802 743 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 LRRC8BQ6P9F7 803 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 B3GNT9Q6UX72 402 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 ADGRF2Q8IZF7 708 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 TMEM130Q8N3G9 435 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 RIN3Q8TB24 985 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 SETD4Q9NVD3 440 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 EVPLLA8MZ36 301 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 RNF103O00237 685 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 TPP1O14773 563 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 CSH1P0DML2 217 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 CSH2P0DML3 217 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 CCNG1P51959 295 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 SLC18A1P54219 525 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 ADIGQ0VDE8 80 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 UNC5AQ6ZN44 842 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 ADCK2Q7Z695 626 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 SKA1Q96BD8 255 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 OPTNQ96CV9 577 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms