RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533628.5

RPUSD4-208, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPUSD4, Length 2,053 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4-208ENST00000533628 H0Y626 953 aa13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 KRT7P08729 469 aa13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 CD48P09326 243 aa13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 GOT1P17174 413 aa13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 SSR1P43307 286 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 PLK1P53350 603 aa13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 DPYSQ14117 519 aa13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 SYT10Q6XYQ8 523 aa13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 DAAM2Q86T65 1068 aa13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 FLCNQ8NFG4 579 aa13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 EXOC4Q96A65 974 aa13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 KLC2Q9H0B6 622 aa13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 LMAN1LQ9HAT1 526 aa13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 GGA2Q9UJY4 613 aa13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 SIT1Q9Y3P8 196 aa13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 KRT86O43790 486 aa13.07□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 GPR37L1O60883 481 aa13.07□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 PALMO75781 387 aa13.07□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 AOC1P19801 751 aa13.07□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 EPHB2P29323 1055 aa13.07□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 CLCN5P51795 746 aa13.07□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 CDH18Q13634 790 aa13.07□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 GAS6Q14393 721 aa13.07□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 FUT11Q495W5 492 aa13.07□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 DGKKQ5KSL6 1271 aa13.07□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 EMC10Q5UCC4 262 aa13.07□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 RFX8Q6ZV50 586 aa13.07□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa13.07□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 NT5DC3Q86UY8 548 aa13.07□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 RHOT1Q8IXI2 618 aa13.07□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 APCDD1Q8J025 514 aa13.07□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 RAPGEF5Q92565 580 aa13.07□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 PBXIP1Q96AQ6 731 aa13.07□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 MFSD1Q9H3U5 465 aa13.07□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 GUCA1BQ9UMX6 200 aa13.07□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 TBC1D3BA6NDS4 549 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 FAM86C2PA6NEL3 165 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 PSTPIP1O43586 416 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 SPOPO43791 374 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 CSKP41240 450 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 RPS9P46781 194 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 MARCKSL1P49006 195 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 MAPKAPK2P49137 400 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 CDH6P55285 790 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 TPI1P60174 286 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 SLC12A1Q13621 1099 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 DPYSL3Q14195 570 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 FBXO43Q4G163 708 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 SYNPOQ8N3V7 929 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 KRT35Q92764 455 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 TTC17Q96AE7 1141 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 FAF2Q96CS3 445 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 CSPG4P5Q96PW8 444 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 LZTFL1Q9NQ48 299 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 KLHL11Q9NVR0 708 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 CHD5Q8TDI0 1954 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 DLL1O00548 723 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 DCLK1O15075 740 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 ERCC2P18074 760 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 KDELR1P24390 212 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 CTNNA2P26232 953 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 GJC1P36383 396 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 MMRN1Q13201 1228 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 DMC1Q14565 340 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 PDK2Q15119 407 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 ELF2Q15723 593 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 PLEKHG6Q3KR16 790 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 PITRM1Q5JRX3 1037 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 Q6ZS52 159 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 AHI1Q8N157 1196 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 FBXL6Q8N531 539 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 USP33Q8TEY7 942 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 PSMB7Q99436 277 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 FEM1AQ9BSK4 669 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 ELOVL2Q9NXB9 296 aa13.06□□□□□ -0.32
RPUSD4-208ENST00000533628 A0A0D9SEW6 157 aa13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms