RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 ITIH6Q6UXX5 1313 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 F5H5T6 163 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 CD38P28907 300 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 GNA15P30679 374 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 USP8P40818 1118 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 PPP2CBP62714 309 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 PPP2CAP67775 309 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 ARID5BQ14865 1188 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 SHBQ15464 509 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 ARHGAP44Q17R89 818 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP24.8■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM110Q86TL2 294 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 PDZD3Q86UT5 571 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 KDM1BQ8NB78 822 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 BTN2A3PQ96KV6 586 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM204AQ9H8W3 233 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 A0A1W2PR77 199 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 MED7O43513 233 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 GRAP2O75791 330 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 IGLV3-25P01717 112 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 GOT1P17174 413 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 GGCXP38435 758 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 ADPRHP54922 357 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 PAK1Q13153 545 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 DNAJC3Q13217 504 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 DEFB106AQ8N104 65 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 GALNT15Q8N3T1 639 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 STK32AQ8WU08 396 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 SERAC1Q96JX3 654 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 FZD4Q9ULV1 537 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 TBC1D3EA0A087X179 549 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 KCNU1A8MYU2 1149 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 TBC1D3LB9A6J9 549 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 ITGAVP06756 1048 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 TBC1D3HP0C7X1 549 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 ABCB4P21439 1286 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 IRAK1P51617 712 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 CENPCQ03188 943 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 PDCLQ13371 301 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 CAMK2BQ13554 666 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 POM121L1PQ3SYA9 428 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 BEND5Q7L4P6 421 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 PASD1Q8IV76 773 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 RNF34Q969K3 372 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 MED15Q96RN5 788 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 THAP9Q9H5L6 903 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 KNTC1P50748 2209 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 BECN2A8MW95 431 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 RTN2O75298 545 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 GNA14O95837 355 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 ADH1BP00325 375 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC9A1P19634 815 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 C5AR1P21730 350 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 BNIP3Q12983 259 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 WDTC1Q8N5D0 677 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 EID2Q8N6I1 236 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 TRIM62Q9BVG3 475 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 DDIT4Q9NX09 232 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRJ-205ENST00000527952 ENC1O14682 589 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRJ-205ENST00000527952 DFNA5O60443 496 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRJ-205ENST00000527952 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
PTPRJ-205ENST00000527952 DRD3P35462 400 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRJ-205ENST00000527952 NNMTP40261 264 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRJ-205ENST00000527952 CCR5P51681 352 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRJ-205ENST00000527952 MARSP56192 900 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PTPRJ-205ENST00000527952 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
PTPRJ-205ENST00000527952 INAVAQ3KP66 663 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRJ-205ENST00000527952 ACCSLQ4AC99 568 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRJ-205ENST00000527952 FBXL22Q6P050 247 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRJ-205ENST00000527952 OR52K2Q8NGK3 314 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRJ-205ENST00000527952 FRS2Q8WU20 508 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRJ-205ENST00000527952 SKA1Q96BD8 255 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRJ-205ENST00000527952 LRIG1Q96JA1 1093 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRJ-205ENST00000527952 CPXM1Q96SM3 734 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRJ-205ENST00000527952 GDF3Q9NR23 364 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRJ-205ENST00000527952 SARDHQ9UL12 918 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRJ-205ENST00000527952 FASNP49327 2511 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms