RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525711.1

UBASH3B-202, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-202ENST00000525711 SLC4A11Q8NBS3 891 aa14.73□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 WFDC5Q8TCV5 224 aa14.73□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 EDEM1Q92611 657 aa14.73□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 TTC17Q96AE7 1141 aa14.73□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 WBP1Q96G27 269 aa14.73□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 MTG2Q9H4K7 406 aa14.73□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 CISHQ9NSE2 258 aa14.73□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 HESX1Q9UBX0 185 aa14.73□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 MAST4O15021 2626 aa14.73□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 MYO18BQ8IUG5 2567 aa14.73□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 MSI1O43347 362 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 STX10O60499 249 aa14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 ADH1BP00325 375 aa14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 ACP1P24666 158 aa14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 SLC8A1P32418 973 aa14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 CSKP41240 450 aa14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 SGSHP51688 502 aa14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 RAD23BP54727 409 aa14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 ADPRHP54922 357 aa14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 ADIGQ0VDE8 80 aa14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 BNIP3Q12983 259 aa14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 KCNJ12Q14500 433 aa14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 ARID5BQ14865 1188 aa14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 ANO6Q4KMQ2 910 aa14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 KDM7AQ6ZMT4 941 aa14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 IRF2BP1Q8IU81 584 aa14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 MFSD2AQ8NA29 543 aa14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 OR14C36Q8NHC7 312 aa14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 MYO19Q96H55 970 aa14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 TMEM8AQ9HCN3 771 aa14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 STIM2Q9P246 746 aa14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 CEP83Q9Y592 693 aa14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa14.71□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa14.71□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 TBC1D3EA0A087X179 549 aa14.71□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa14.71□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 TBC1D3LB9A6J9 549 aa14.71□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 PMM2O15305 246 aa14.71□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 MOCS3O95396 460 aa14.71□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 TBC1D3HP0C7X1 549 aa14.71□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 GOT1P17174 413 aa14.71□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 C5AR1P21730 350 aa14.71□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 NUDT1P36639 197 aa14.71□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 PSMD8P48556 350 aa14.71□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 DAB2P98082 770 aa14.71□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 BST2Q10589 180 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 CDH18Q13634 790 aa14.71□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa14.71□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 CCDC40Q4G0X9 1142 aa14.71□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 KRT39Q6A163 491 aa14.71□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa14.71□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa14.71□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 RFWD3Q6PCD5 774 aa14.71□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 PCSK4Q6UW60 755 aa14.71□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 IQCHQ86VS3 1027 aa14.71□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 FAM114A1Q8IWE2 563 aa14.71□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 LSMEM2Q8N112 164 aa14.71□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 FIBINQ8TAL6 211 aa14.71□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 TSPAN16Q9UKR8 245 aa14.71□□□□□ -0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 YJEFN3A6XGL0 299 aa14.7□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 SMTNL1A8MU46 457 aa14.7□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 E7ENQ6 273 aa14.7□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 WNT9AO14904 365 aa14.7□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 ACSL4O60488 711 aa14.7□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 MT-CO3P00414 261 aa14.7□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF165P49910 485 aa14.7□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 MYL5Q02045 173 aa14.7□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 OVGP1Q12889 678 aa14.7□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 SGO2Q562F6 1265 aa14.7□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 C9orf64Q5T6V5 341 aa14.7□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 MSANTD2Q6P1R3 559 aa14.7□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 TRIM59Q8IWR1 403 aa14.7□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 CARNMT1Q8N4J0 409 aa14.7□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 SLC35C1Q96A29 364 aa14.7□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 CLMPQ9H6B4 373 aa14.7□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 CNGB3Q9NQW8 809 aa14.7□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 ERVW-1Q9UQF0 538 aa14.7□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 ITIH6Q6UXX5 1313 aa14.69□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 TULP2O00295 520 aa14.69□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 LATO43561 262 aa14.69□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 IL1BP01584 269 aa14.69□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms