RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516259.1

RNU6-390P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 390, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-390P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-390P-201ENST00000516259 KCND2Q9NZV8 630 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 MPP6Q9NZW5 540 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 AASSQ9UDR5 926 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 EMSYQ7Z589 1322 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 PI4KAP2A4QPH2 592 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 TARM1B6A8C7 271 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 DSCR3O14972 297 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 FOXN1O15353 648 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 CCNDBP1O95273 360 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 LCKP06239 509 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 LAMP2P13473 410 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 COX7A2P14406 83 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 AVPR2P30518 371 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 BLKP51451 505 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 CDH15P55291 814 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 ABHD18Q0P651 414 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 NFIL3Q16649 462 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 MTFR2Q6P444 385 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 TMEM65Q6PI78 240 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 SPRED1Q7Z699 444 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 NEK8Q86SG6 692 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 TMEM200AQ86VY9 491 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 BRSK2Q8IWQ3 736 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 UEVLDQ8IX04 471 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 STAMQ92783 540 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 ELP4Q96EB1 424 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 CLSTN3Q9BQT9 956 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 CLPBQ9H078 707 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 NUAK2Q9H093 628 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 BRF2Q9HAW0 419 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 ASNSD1Q9NWL6 643 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 CNPY2Q9Y2B0 182 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 SALL3Q9BXA9 1300 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 C16orf96A6NNT2 1141 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 SPTLC2O15270 562 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 TNFSF14O43557 240 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 HBP1O60381 514 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 PDE8BO95263 885 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 GCP02774 474 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 UBL4AP11441 157 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 KRT4P19013 534 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 BSGP35613 385 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 SOX2P48431 317 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 HSF1Q00613 529 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 B4GALNT1Q00973 533 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 ERV3-1Q14264 604 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 TSTQ16762 297 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 RANBP10Q6VN20 620 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 MDGA2Q7Z553 956 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 VRK3Q8IV63 474 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 C11orf65Q8NCR3 313 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 ETNPPLQ8TBG4 499 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 CREB3L4Q8TEY5 395 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 HDAC7Q8WUI4 952 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 UCMAQ8WVF2 138 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 SAAL1Q96ER3 474 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 CLMNQ96JQ2 1002 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 TIGD1Q96MW7 591 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 GPR78Q96P69 363 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 DUSP26Q9BV47 211 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 TRIM31Q9BZY9 425 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 MUC13Q9H3R2 512 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 VEZTQ9HBM0 779 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 TMEM248Q9NWD8 314 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 VPS4AQ9UN37 437 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 TTLL3Q9Y4R7 772 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 C17orf100A8MU93 164 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 EXOC3O60645 756 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 GCATO75600 419 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 SEC14L2O76054 403 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 ACADMP11310 421 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 AKR1A1P14550 325 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 GSTM2P28161 218 aa3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms