RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516230.1

RNU6-287P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 287, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-287P, Length 98 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-287P-201ENST00000516230 AGTR2P50052 363 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 MAP2K6P52564 334 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 DGKQP52824 942 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZBTB16Q05516 673 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 XKR9Q5GH70 373 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZDHHC24Q6UX98 284 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 Q6ZVH6 145 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 Q7L0L9 218 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 MON1BQ7L1V2 547 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 ADGRA1Q86SQ6 560 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 LRRTM1Q86UE6 522 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 PALB2Q86YC2 1186 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF584Q8IVC4 421 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 MPP5Q8N3R9 675 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC25A41Q8N5S1 370 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 Q8N7P7 452 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 DMBX1Q8NFW5 382 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR52N4Q8NGI2 321 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 ASB12Q8WXK4 309 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 KAT2AQ92830 837 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 PMM1Q92871 262 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC35A4Q96G79 324 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAXDC2Q96IV6 333 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 C17orf77Q96MU5 243 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 LINC00167Q96N53 147 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 VGLL1Q99990 258 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMX1Q9H3N1 280 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 EBF2Q9HAK2 575 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 PTPRHQ9HD43 1115 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 FANCLQ9NW38 375 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 SERPINB13Q9UIV8 391 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 RIMKLBQ9ULI2 386 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 AGRNO00468 2067 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 ABCA13Q86UQ4 5058 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 A0A1B0GVM2 712 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 BTN3A1O00481 513 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 XPOTO43592 962 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 LDB2O43679 373 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 ITM2AO43736 263 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 AP1G1O43747 822 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 PCDH7O60245 1069 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 PCDHGA12O60330 932 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 PIAS2O75928 621 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 NEURL1O76050 574 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 WDR47O94967 919 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 IGLV1-44P01699 117 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 RFPL3SP0C7P2 107 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 SRCP12931 536 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 DPEP1P16444 411 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 TSHRP16473 764 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 PDCP20941 246 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 MMP8P22894 467 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 MCM3P25205 808 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 SHC1P29353 583 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 TYK2P29597 1187 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC8A1P32418 973 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 TNFSF8P32971 234 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 AVPR1AP37288 418 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 ITGA8P53708 1063 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 ADKP55263 362 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 NLRP5P59047 1200 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 STK3Q13188 491 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 RAB32Q13637 225 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 ARHGEF7Q14155 803 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 ELF2Q15723 593 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF284Q2VY69 593 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 C10orf76Q5T2E6 689 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM166AQ6J272 317 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 AAGABQ6PD74 315 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 LCTLQ6UWM7 567 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 IGFL3Q6UXB1 125 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF783Q6ZMS7 281 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 IGFN1Q86VF2 1251 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-287P-201ENST00000516230 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa0.44□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms