RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	FRS2	Q8WU20	508 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	PTPRN2	Q92932	1015 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM129B	Q96TA1	746 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	SIK2	Q9H0K1	926 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	FBRS	Q9HAH7	460 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	SUN2	Q9UH99	717 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A1B0GTH6	734 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	METTL12	A8MUP2	240 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	NDUFS2	O75306	463 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	SERPINF2	P08697	491 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	ENG	P17813	658 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	OXTR	P30559	389 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	DPP6	P42658	865 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF165	P49910	485 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	IL31	Q6EBC2	164 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	MON1B	Q7L1V2	547 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM124A	Q86V42	546 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM131B	Q86XD5	332 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	C1orf74	Q96LT6	269 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	PSMB7	Q99436	277 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	NUP58	Q9BVL2	599 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLDN11	O75508	207 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	MOCS3	O95396	460 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	F9	P00740	461 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACADM	P11310	421 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDH4	P55283	916 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	ST8SIA6	P61647	398 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	BNC1	Q01954	994 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZBTB16	Q05516	673 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	STK40	Q8N2I9	435 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	CEP76	Q8TAP6	659 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	FOXJ1	Q92949	421 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	HAPLN3	Q96S86	360 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	AGPAT1	Q99943	283 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	MPP6	Q9NZW5	540 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	NEU3	Q9UQ49	428 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	KNL1	Q8NG31	2342 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A0D9SEW6	157 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	SYCE3	A1L190	88 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	SMTNL1	A8MU46	457 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014		E9PAM4	449 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	MID1	O15344	667 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATP9B	O43861	1147 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	GJB3	O75712	270 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	MT-CO1	P00395	513 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	CFI	P05156	583 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADRB1	P08588	477 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	PTPN9	P43378	593 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	METAP1	P53582	386 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	HDAC4	P56524	1084 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATP11A	P98196	1134 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	SULT2A1	Q06520	285 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	NR1I3	Q14994	352 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	CST6	Q15828	149 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32

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