RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504263.1

PCAT4-201, prostate cancer associated transcript 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCAT4, Length 2,091 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCAT4-201ENST00000504263 ECDO95905 644 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 BCL10O95999 233 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 CD4P01730 458 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ERBB2P04626 1255 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PGK2P07205 417 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TRAPPC2P0DI81 140 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TRAPPC2BP0DI82 140 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 CDH1P12830 882 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
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PCAT4-201ENST00000504263 CYP3A5P20815 502 aa3.59□□□□□ -1.83
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PCAT4-201ENST00000504263 CA4P22748 312 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 GCAP28676 217 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 SERPINB1P30740 379 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 EPHX2P34913 555 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PTPN9P43378 593 aa3.59□□□□□ -1.83
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PCAT4-201ENST00000504263 BNC1Q01954 994 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PTK2Q05397 1052 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 CYP4F3Q08477 520 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 FAAP100Q0VG06 881 aa3.59□□□□□ -1.83
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PCAT4-201ENST00000504263 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 AOC3Q16853 763 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 LRRC36Q1X8D7 754 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 INAVAQ3KP66 663 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 FBXO43Q4G163 708 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ESCO2Q56NI9 601 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ATG16L1Q676U5 607 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PRR23BQ6ZRT6 265 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 KIAA0408Q6ZU52 694 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 NIPA1Q7RTP0 329 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TTC7BQ86TV6 843 aa3.59□□□□□ -1.83
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PCAT4-201ENST00000504263 LDHDQ86WU2 507 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ADGRG5Q8IZF4 528 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 LINC00518Q8N0U6 118 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 FBXW8Q8N3Y1 598 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 C4orf32Q8N8J7 132 aa3.59□□□□□ -1.83
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PCAT4-201ENST00000504263 ATP2A3Q93084 1043 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 C18orf8Q96DM3 657 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TMEM80Q96HE8 168 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 SUCLG2Q96I99 432 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 MAP6Q96JE9 813 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 SCYL1Q96KG9 808 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TNIP3Q96KP6 325 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ASB2Q96Q27 587 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ACAT2Q9BWD1 397 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 NAPBQ9H115 298 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 OR51B5Q9H339 312 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 FAM96AQ9H5X1 160 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ANKHQ9HCJ1 492 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 FBXO8Q9NRD0 319 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 IGSF5Q9NSI5 407 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 CNTN3Q9P232 1028 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 MBD2Q9UBB5 411 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ATP6V1HQ9UI12 483 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 CDH22Q9UJ99 828 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PSME2Q9UL46 239 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
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PCAT4-201ENST00000504263 KCNJ14Q9UNX9 436 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF541Q9H0D2 1346 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 A0A1W2PPW3 197 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 SMCO2A6NFE2 343 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TRPC5OSA6NMA1 111 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 FIGNL2A6NMB9 653 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 GOLGA8JA6NMD2 632 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 C16orf96A6NNT2 1141 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TTLL8A6PVC2 850 aa3.59□□□□□ -1.83
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