RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		4	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		4	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		4	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	RAB21	Q9UL25	225 aa		4	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		4	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		4	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		4	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		4	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	WDR81	Q562E7	1941 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	PRSS47	A8MTI9	375 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	SMTNL1	A8MU46	457 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	BTBD18	B2RXH4	712 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	PCDH17	O14917	1159 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	NCK2	O43639	380 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	IDE	P14735	1019 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	CHRNB2	P17787	502 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	TAS2R50	P59544	299 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	COASY	Q13057	564 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	TRAF3	Q13114	568 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	PMS2P11	Q13670	270 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	FAR2	Q96K12	515 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	FAM50B	Q9Y247	325 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	NTSR2	O95665	410 aa		3.98	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	GLUD1	P00367	558 aa		3.98	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	CYP3A4	P08684	503 aa		3.98	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	ATF3	P18847	181 aa		3.98	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	SLC16A2	P36021	539 aa		3.98	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	KCNJ4	P48050	445 aa		3.98	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	GLUD2	P49448	558 aa		3.98	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	ADPRH	P54922	357 aa		3.98	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	3.98	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	HNF4G	Q14541	408 aa		3.98	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		3.98	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		3.98	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	APOLD1	Q96LR9	279 aa		3.98	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		3.98	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	FZD10	Q9ULW2	581 aa		3.98	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		3.97	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	STMND1	H3BQB6	276 aa		3.97	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	ANXA6	P08133	673 aa		3.97	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	CYP3A7	P24462	503 aa		3.97	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	KLRK1	P26718	216 aa		3.97	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	TMPRSS3	P57727	454 aa		3.97	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	ZP1	P60852	638 aa		3.97	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		3.97	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	ALG10	Q5BKT4	473 aa		3.97	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		3.97	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	FAM209B	Q5JX69	171 aa		3.97	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		3.97	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		3.97	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	MECR	Q9BV79	373 aa		3.97	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		3.97	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
USP34-222	ENST00000498268	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		3.96	□□□□□ -1.78
USP34-222	ENST00000498268	LINC01565	O15544	149 aa		3.96	□□□□□ -1.78
USP34-222	ENST00000498268	LIAS	O43766	372 aa		3.96	□□□□□ -1.78
USP34-222	ENST00000498268	LDB3	O75112	727 aa		3.96	□□□□□ -1.78
USP34-222	ENST00000498268	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
USP34-222	ENST00000498268	LCK	P06239	509 aa		3.96	□□□□□ -1.78
USP34-222	ENST00000498268	PRSS2	P07478	247 aa		3.96	□□□□□ -1.78
USP34-222	ENST00000498268	KLRC2	P26717	231 aa		3.96	□□□□□ -1.78
USP34-222	ENST00000498268	TLE3	Q04726	772 aa		3.96	□□□□□ -1.78
USP34-222	ENST00000498268	PKP1	Q13835	747 aa		3.96	□□□□□ -1.78
USP34-222	ENST00000498268	AAGAB	Q6PD74	315 aa		3.96	□□□□□ -1.78
USP34-222	ENST00000498268	CCDC25	Q86WR0	208 aa		3.96	□□□□□ -1.78
USP34-222	ENST00000498268	TTC30A	Q86WT1	665 aa		3.96	□□□□□ -1.78
USP34-222	ENST00000498268	DGKH	Q86XP1	1220 aa		3.96	□□□□□ -1.78
USP34-222	ENST00000498268	C18orf8	Q96DM3	657 aa		3.96	□□□□□ -1.78
USP34-222	ENST00000498268	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		3.96	□□□□□ -1.78
USP34-222	ENST00000498268	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		3.95	□□□□□ -1.78
USP34-222	ENST00000498268	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
USP34-222	ENST00000498268	FCGR1A	P12314	374 aa		3.95	□□□□□ -1.78
USP34-222	ENST00000498268	RHAG	Q02094	409 aa		3.95	□□□□□ -1.78
USP34-222	ENST00000498268	RAB30	Q15771	203 aa		3.95	□□□□□ -1.78
USP34-222	ENST00000498268	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		3.95	□□□□□ -1.78
USP34-222	ENST00000498268	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
USP34-222	ENST00000498268	FSCB	Q5H9T9	825 aa		3.95	□□□□□ -1.78
USP34-222	ENST00000498268	TRABD2A	Q86V40	505 aa		3.95	□□□□□ -1.78
USP34-222	ENST00000498268	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		3.95	□□□□□ -1.78
USP34-222	ENST00000498268	TTC17	Q96AE7	1141 aa		3.95	□□□□□ -1.78

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