RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498007.1

HLA-B-255, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 1,087 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-255ENST00000498007 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 VPS28Q9UK41 221 aa20.35■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa20.35■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 STON1Q9Y6Q2 735 aa20.35■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 WASH3PC4AMC7 463 aa20.34■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 DLDP09622 509 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 TDGF1P13385 188 aa20.34■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 IL1R2P27930 398 aa20.34■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 EPHB2P29323 1055 aa20.34■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 TPI1P60174 286 aa20.34■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 DMWDQ09019 674 aa20.34■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 SLC12A1Q13621 1099 aa20.34■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 MESDQ14696 234 aa20.34■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 CRY1Q16526 586 aa20.34■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa20.34■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 ACRBPQ8NEB7 543 aa20.34■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 FAM86C1Q9NVL1 165 aa20.34■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 PLA2G4CQ9UP65 541 aa20.34■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 APBB3O95704 486 aa20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 ASLP04424 464 aa20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 HLA-EP13747 358 aa20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 RHOQP17081 205 aa20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 PRKCHP24723 683 aa20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 DGKEP52429 567 aa20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 SEMA3BQ13214 749 aa20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 E2F5Q15329 346 aa20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 PTPRNQ16849 979 aa20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF528Q3MIS6 628 aa20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF366Q8N895 744 aa20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 TTC17Q96AE7 1141 aa20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 GABRG3Q99928 467 aa20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 FEM1AQ9BSK4 669 aa20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF212Q9UDV6 495 aa20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 DNAI1Q9UI46 699 aa20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 LCMT1Q9UIC8 334 aa20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-255ENST00000498007 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 NPC1O15118 1278 aa20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 MTA2O94776 668 aa20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 NOP2P46087 812 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 FNTBP49356 437 aa20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 ST8SIA6P61647 398 aa20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 ECT2LQ008S8 904 aa20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 STARD3Q14849 445 aa20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 HADHQ16836 314 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 ANO7Q6IWH7 933 aa20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 KIAA1211LQ6NV74 962 aa20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 NLRP14Q86W24 1093 aa20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 PPP1R9BQ96SB3 815 aa20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 DESI2Q9BSY9 194 aa20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 NDFIP2Q9NV92 336 aa20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 TMEM248Q9NWD8 314 aa20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 ERVW-1Q9UQF0 538 aa20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 A0A0D9SEW6 157 aa20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 A0A1W2PQF6 199 aa20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 EPHX1P07099 455 aa20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 RARAP10276 462 aa20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 GOT1P17174 413 aa20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 MAN1A1P33908 653 aa20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 MAPKAPK2P49137 400 aa20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 STK19P49842 368 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 NRLP54845 237 aa20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 BOLA3Q53S33 107 aa20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 CAMKK1Q8N5S9 505 aa20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 OR7D4Q8NG98 312 aa20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 HMGB4Q8WW32 186 aa20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 ALG14Q96F25 216 aa20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 SPON2Q9BUD6 331 aa20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 SLC25A13Q9UJS0 675 aa20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 OR51B4Q9Y5P0 310 aa20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 R4GN57 208 aa20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 ILVBLA1L0T0 632 aa20.3■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 DAPK3O43293 454 aa20.3■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 ALDH1A2O94788 518 aa20.3■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 HTR7P34969 479 aa20.3■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 ARHGAP25P42331 645 aa20.3■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 MRE11P49959 708 aa20.3■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 PLK1P53350 603 aa20.3■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 TAS2R40P59535 323 aa20.3■□□□□ 0.84
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HLA-B-255ENST00000498007 SULT2A1Q06520 285 aa20.3■□□□□ 0.84
HLA-B-255ENST00000498007 ENPP2Q13822 863 aa20.3■□□□□ 0.84
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