RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482107.1

FNBP1-208, Transcript of formin binding protein 1, human

TSL 3

Gene FNBP1, Length 334 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FNBP1-208	ENST00000482107	ITIH5	Q86UX2	942 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	LZTR1	Q8N653	840 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	RAPGEF5	Q92565	580 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	OLFM3	Q96PB7	478 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	RNF157	Q96PX1	679 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	PSMB7	Q99436	277 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	RAB17	Q9H0T7	212 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	NMUR1	Q9HB89	426 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	GDF3	Q9NR23	364 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	TLR9	Q9NR96	1032 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	PIGV	Q9NUD9	493 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	FZD10	Q9ULW2	581 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	MYH10	P35580	1976 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	LRRD1	A4D1F6	860 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107		H3BRJ5	948 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107		I6L893	689 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107		M0QYT0	321 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	GFRA2	O00451	464 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	CAPN9	O14815	690 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	DCLK1	O15075	740 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	MTSS1	O43312	755 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	LIAS	O43766	372 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	TLR5	O60602	858 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	PRMT3	O60678	531 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	GAS8	O95995	478 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	GLUD1	P00367	558 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	CTNNB1	P35222	781 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	SERPINB6	P35237	376 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	ARL4A	P40617	200 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	MAGEA6	P43360	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	ALDH1A3	P47895	512 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	CLCN4	P51793	760 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	EPHB3	P54753	998 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	CDH6	P55285	790 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	SLC7A9	P82251	487 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	ATP11A	P98196	1134 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	DR1	Q01658	176 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	CAV1	Q03135	178 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	TNK2	Q07912	1038 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	TAF10	Q12962	218 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	PTK6	Q13882	451 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	KCNC3	Q14003	757 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	CAMK1	Q14012	370 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	ELF2	Q15723	593 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	DDR2	Q16832	855 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	MAP9	Q49MG5	647 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	DUPD1	Q68J44	220 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	TTC27	Q6P3X3	843 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	EMB	Q6PCB8	327 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	CEP57	Q86XR8	500 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	TMC8	Q8IU68	726 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	RELL1	Q8IUW5	271 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FNBP1-208	ENST00000482107	IFT20	Q8IY31	132 aa		4.56	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms