RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482072.1

ABCA9-205, Transcript of ATP binding cassette subfamily A member 9, human

TSL 3

Gene ABCA9, Length 235 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCA9-205	ENST00000482072	AADACL2	Q6P093	401 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072		Q6YL49	198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	ADSSL1	Q8N142	457 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	GPR78	Q96P69	363 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	IL21R	Q9HBE5	538 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	MPP6	Q9NZW5	540 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	STRN	O43815	780 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	CLEC3B	P05452	202 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	CHRM4	P08173	479 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	UBL4A	P11441	157 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	COX7A2	P14406	83 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	ARSA	P15289	507 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	ITPKB	P27987	946 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	GJC1	P36383	396 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	ADPRH	P54922	357 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	B4GALNT1	Q00973	533 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	DMWD	Q09019	674 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	CCNG2	Q16589	344 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	GJB7	Q6PEY0	223 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	CAGE1	Q8TC20	777 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	ELP4	Q96EB1	424 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	EYA3	Q99504	573 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	NUAK2	Q9H093	628 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	SYNC	Q9H7C4	482 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	POLG2	Q9UHN1	485 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	SARDH	Q9UL12	918 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	GPR34	Q9UPC5	381 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	EMSY	Q7Z589	1322 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	PRY	O14603	147 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	GFPT2	O94808	682 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	KAT7	O95251	611 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	ABCD1	P33897	745 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	BSG	P35613	385 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	SHC2	P98077	582 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	DGCR2	P98153	550 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	NUCB1	Q02818	461 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	MTFR2	Q6P444	385 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	VPS52	Q8N1B4	723 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	FAM47B	Q8NA70	645 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	METTL6	Q8TCB7	284 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	KAZALD1	Q96I82	304 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	DHDH	Q9UQ10	334 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	PKP3	Q9Y446	797 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	SEC14L2	O76054	403 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	LYL1	P12980	280 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	LAMP2	P13473	410 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	AKR1A1	P14550	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	AVPR2	P30518	371 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	MCM7	P33993	719 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	ADRA1B	P35368	520 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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