RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 HTR3BO95264 441 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 SLC5A1P13866 664 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 PLCG1P19174 1290 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 CD53P19397 219 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 PON1P27169 355 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 PEX2P28328 305 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 MCM7P33993 719 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 MAGEA4P43358 317 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 DNA2P51530 1060 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 AP3M2P53677 418 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 SLC5A3P53794 718 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 KRT17Q04695 432 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 PRKCQQ04759 706 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 SLC18A2Q05940 514 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 RAD51Q06609 339 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 FCHO2Q0JRZ9 810 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 CCNIQ14094 377 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 COG2Q14746 738 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 PSMD6Q15008 389 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 MAPRE2Q15555 327 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 CCNG2Q16589 344 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 EXOC3L4Q17RC7 722 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 ANO4Q32M45 955 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 GRAMD1BQ3KR37 738 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 CDONQ4KMG0 1287 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 ARCQ7LC44 396 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 PCGF5Q86SE9 256 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 TXNRD3Q86VQ6 643 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 CLYBLQ8N0X4 340 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 FBXW8Q8N3Y1 598 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 BANPQ8N9N5 519 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 GALNT11Q8NCW6 608 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 HCAR2Q8TDS4 363 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 E2F7Q96AV8 911 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 VMP1Q96GC9 406 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 EGLN2Q96KS0 407 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.242e-6■□□□□ 10.5
PKP4-211ENST00000481115 GON7Q9BXV9 100 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 ANKRD60Q9BZ19 345 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 ZNF304Q9HCX3 659 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 CASS4Q9NQ75 786 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 PARVAQ9NVD7 372 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 GMIPQ9P107 970 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 STK39Q9UEW8 545 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 PCDHB10Q9UN67 800 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 NR2E1Q9Y466 385 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 CPQQ9Y646 472 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 GAKO14976 1311 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 A0A0G2JND7 137 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 A0A1W2PQU0 124 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 FAM25AB3EWG3 89 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 FAM25CB3EWG5 89 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 FAM25GB3EWG6 89 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 CLDN25C9JDP6 229 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 hCG_1984214I3L0E3 225 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 TRAF5O00463 557 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 XPOTO43592 962 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 GUCY1B2O75343 617 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 GPC4O75487 556 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 GMNNO75496 209 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 MAP3K6O95382 1288 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 B3GALT4O96024 378 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 F2P00734 622 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 OR52Z1P0C646 297 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 ACRP10323 421 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 MCF2P10911 925 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 MYL2P10916 166 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 BMP1P13497 986 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 NCAM1P13591 858 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 NME1P15531 152 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 RAG1P15918 1043 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 NAGAP17050 411 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 RPA1P27694 616 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 STT3AP46977 705 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 BMXP51813 675 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 COPAP53621 1224 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 ITGA8P53708 1063 aa7.32□□□□□ -1.24
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