RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479554.5

ATG4B-218, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-218ENST00000479554 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 APCDD1Q8J025 514 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 CAMK1GQ96NX5 476 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 IL21RQ9HBE5 538 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 TM9SF3Q9HD45 589 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 FBXL12Q9NXK8 326 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 FHOD1Q9Y613 1164 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 ZFHX4Q86UP3 3567 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 A0A1W2PP55 124 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 FAM47DPA6NHR8 397 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 M0QYT0 321 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 TRIM16O95361 564 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 C1QTNF9P0C862 333 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF883P0CG24 379 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 CD27P26842 260 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 NNMTP40261 264 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 GRIA4P48058 902 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 PSMD8P48556 350 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 NUMBP49757 651 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 STK19P49842 368 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 OXCT1P55809 520 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 TPM4P67936 248 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 SULT2A1Q06520 285 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF423Q2M1K9 1284 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 HLA-BQ31612 363 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 FBXL22Q6P050 247 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 AOPEPQ8N6M6 819 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 TMEM35BQ8NCS4 154 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 OMDQ99983 421 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 OSGEPQ9NPF4 335 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 TM7SF3Q9NS93 570 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 RRN3Q9NYV6 651 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 SERGEFQ9UGK8 458 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 VANGL2Q9ULK5 521 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 HS3ST4Q9Y661 456 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 NUMA1Q14980 2115 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 ZZEF1O43149 2961 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 CYP11B1P15538 503 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 SLC8A1P32418 973 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 GGCXP38435 758 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 KCNMA1Q12791 1236 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 AUHQ13825 339 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 TCP11X2Q5H9J9 407 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 TAF3Q5VWG9 929 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 KIAA0895LQ68EN5 471 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 STK40Q8N2I9 435 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 PTPRN2Q92932 1015 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 IGSF8Q969P0 613 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 SLC25A13Q9UJS0 675 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 FZD4Q9ULV1 537 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 STAP1Q9ULZ2 295 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 SPEGQ15772 3267 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 LRRC72A6NJI9 287 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 ADCY5O95622 1261 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 ADH1BP00325 375 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 IGHV4-34P06331 123 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 UCHL3P15374 230 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 SULT1E1P49888 294 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 IRAK1P51617 712 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 PLK1P53350 603 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 GALCP54803 685 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 KIF19Q2TAC6 998 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 BRMS1LQ5PSV4 323 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 NCEH1Q6PIU2 408 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 LAYNQ6UX15 382 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 MSANTD4Q8NCY6 345 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 OR2T34Q8NGX1 318 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 FAM129BQ96TA1 746 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 NPY6RQ99463 290 aa14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms