RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 NPAS1Q99742 590 aa7.51□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 CLPBQ9H078 707 aa7.51□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 POT1Q9NUX5 634 aa7.51□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 SLC25A13Q9UJS0 675 aa7.51□□□□□ -1.21
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SGCE-210ENST00000472326 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
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SGCE-210ENST00000472326 TMEM217Q8N7C4 229 aa7.5□□□□□ -1.21
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SGCE-210ENST00000472326 ATG13O75143 517 aa7.49□□□□□ -1.21
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SGCE-210ENST00000472326 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 FAM167BQ9BTA0 163 aa7.49□□□□□ -1.21
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SGCE-210ENST00000472326 CLMNQ96JQ2 1002 aa7.48□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 TRIM31Q9BZY9 425 aa7.48□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 CHODLQ9H9P2 273 aa7.48□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 DECR2Q9NUI1 292 aa7.48□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 ANAPC4Q9UJX5 808 aa7.48□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 SQORQ9Y6N5 450 aa7.48□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.47□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 FAM155BO75949 473 aa7.47□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 PKMP14618 531 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.47□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 LEXMQ3ZCV2 418 aa7.47□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 LRCH2Q5VUJ6 765 aa7.47□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 PIM3Q86V86 326 aa7.47□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 CCDC25Q86WR0 208 aa7.47□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 ZNF366Q8N895 744 aa7.47□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 AFG1LQ8WV93 481 aa7.47□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 NLRP4Q96MN2 994 aa7.47□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 ACAD9Q9H845 621 aa7.47□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 PPCSQ9HAB8 311 aa7.47□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 B9A039 149 aa7.46□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 CSF1P09603 554 aa7.46□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 TYK2P29597 1187 aa7.46□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 ADD2P35612 726 aa7.46□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 CCT4P50991 539 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 PRTGQ2VWP7 1150 aa7.46□□□□□ -1.22
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