RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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USP54-210ENST00000466048 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP7.84□□□□□ -1.15
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USP54-210ENST00000466048 SCYL1Q96KG9 808 aa7.84□□□□□ -1.15
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USP54-210ENST00000466048 SYCP2LQ5T4T6 812 aa7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 FUT10Q6P4F1 479 aa7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa7.84□□□□□ -1.15
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USP54-210ENST00000466048 RELL1Q8IUW5 271 aa7.84□□□□□ -1.15
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USP54-210ENST00000466048 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP7.84□□□□□ -1.15
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USP54-210ENST00000466048 DUSP16Q9BY84 665 aa7.84□□□□□ -1.15
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USP54-210ENST00000466048 CDHR5Q9HBB8 845 aa7.84□□□□□ -1.15
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USP54-210ENST00000466048 PCSK1NQ9UHG2 260 aa7.84□□□□□ -1.15
USP54-210ENST00000466048 SH3BP5O60239 455 aa7.84□□□□□ -1.16
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USP54-210ENST00000466048 RETSATQ6NUM9 610 aa7.84□□□□□ -1.16
USP54-210ENST00000466048 ZDHHC24Q6UX98 284 aa7.84□□□□□ -1.16
USP54-210ENST00000466048 CAPN12Q6ZSI9 719 aa7.84□□□□□ -1.16
USP54-210ENST00000466048 FRA10AC1Q70Z53 315 aa7.84□□□□□ -1.16
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USP54-210ENST00000466048 BRD8Q9H0E9 1235 aa7.84□□□□□ -1.16
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USP54-210ENST00000466048 ACRP10323 421 aa7.83□□□□□ -1.16
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USP54-210ENST00000466048 NR2C2P49116 596 aa7.83□□□□□ -1.16
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USP54-210ENST00000466048 SEC24CP53992 1094 aa7.83□□□□□ -1.16
USP54-210ENST00000466048 LILRA4P59901 499 aa7.83□□□□□ -1.16
USP54-210ENST00000466048 GPS1Q13098 491 aa7.83□□□□□ -1.16
USP54-210ENST00000466048 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
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USP54-210ENST00000466048 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
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USP54-210ENST00000466048 MUC3BQ9H195 1237 aa7.83□□□□□ -1.16
USP54-210ENST00000466048 EVA1BQ9NVM1 165 aa7.83□□□□□ -1.16
USP54-210ENST00000466048 DDIT4Q9NX09 232 aa7.83□□□□□ -1.16
USP54-210ENST00000466048 HES2Q9Y543 173 aa7.83□□□□□ -1.16
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USP54-210ENST00000466048 SPAG6O75602 509 aa7.83□□□□□ -1.16
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USP54-210ENST00000466048 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
USP54-210ENST00000466048 KYNUQ16719 465 aa7.83□□□□□ -1.16
USP54-210ENST00000466048 LLGL2Q6P1M3 1020 aa7.83□□□□□ -1.16
USP54-210ENST00000466048 TTC23LQ6PF05 361 aa7.83□□□□□ -1.16
USP54-210ENST00000466048 ATPAF2Q8N5M1 289 aa7.83□□□□□ -1.16
USP54-210ENST00000466048 FAM172AQ8WUF8 416 aa7.83□□□□□ -1.16
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