RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 ST8SIA6P61647 398 aa17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 ECT2LQ008S8 904 aa17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 H2AFVQ71UI9 128 aa17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 C11orf74Q86VG3 221 aa17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 OR52K2Q8NGK3 314 aa17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 MYO19Q96H55 970 aa17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 MRGPRX3Q96LB0 322 aa17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 UVRAGQ9P2Y5 699 aa17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 IP6K2Q9UHH9 426 aa17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 ERVW-1Q9UQF0 538 aa17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 RAD54BQ9Y620 910 aa17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 ILVBLA1L0T0 632 aa17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM72CH0Y354 149 aa17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 RPP40O75818 363 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 RHOCP08134 193 aa17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 OR1E1P30953 314 aa17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 HTR7P34969 479 aa17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 NNMTP40261 264 aa17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 ERMARDQ5T6L9 678 aa17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM72AQ5TYM5 149 aa17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM72DQ6L9T8 149 aa17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM72BQ86X60 149 aa17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 NIPA2Q8N8Q9 360 aa17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 HMGB4Q8WW32 186 aa17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 TBC1D31Q96DN5 1066 aa17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 ARHGEF26Q96DR7 871 aa17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 NUP85Q9BW27 656 aa17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 MAGEB5Q9BZ81 275 aa17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 FBRSQ9HAH7 460 aa17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 PRR23AA6NEV1 266 aa17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 MYO1FO00160 1098 aa17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 LRCH4O75427 683 aa17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 EPHX1P07099 455 aa17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM253P0C7T8 217 aa17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 MIPP30301 263 aa17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 MAPKAPK2P49137 400 aa17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 SEMA3BQ13214 749 aa17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 ASCL5Q7RTU5 278 aa17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 NLRP14Q86W24 1093 aa17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 PGBD3Q8N328 593 aa17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 MRGPRX1Q96LB2 322 aa17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 PANX2Q96RD6 677 aa17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 EPAS1Q99814 870 aa17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM248Q9NWD8 314 aa17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 LCMT1Q9UIC8 334 aa17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 INTUQ9ULD6 942 aa17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 WASH4PA8MWX3 477 aa17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 PRPSAP2O60256 369 aa17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF217O75362 1048 aa17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 HLA-EP13747 358 aa17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 NDUFV2P19404 249 aa17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 P2RY2P41231 377 aa17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 MRE11P49959 708 aa17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 KRT83P78385 493 aa17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 MAP7D1Q3KQU3 841 aa17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 BOLA3Q53S33 107 aa17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 CEP68Q76N32 757 aa17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 TMPRSS6Q8IU80 811 aa17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC170Q8IYT3 715 aa17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 PYROXD2Q8N2H3 581 aa17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 OR2T3Q8NH03 318 aa17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 TPSD1Q9BZJ3 242 aa17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 MUC3BQ9H195 1237 aa17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 PRSS16Q9NQE7 514 aa17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 DONSONQ9NYP3 566 aa17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 PCSK1NQ9UHG2 260 aa17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 ANAPC7Q9UJX3 599 aa17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 VPS28Q9UK41 221 aa17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 RAB23Q9ULC3 237 aa17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 USP18Q9UMW8 372 aa17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 NEU3Q9UQ49 428 aa17.3■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 GFRA3O60609 400 aa17.29■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 FECHP22830 423 aa17.29■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 EPHB2P29323 1055 aa17.29■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 CDC25BP30305 580 aa17.29■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 ETFBP38117 255 aa17.29■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 COPAP53621 1224 aa17.29■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC20A2Q08357 652 aa17.29■□□□□ 0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 DCAF4L2Q8NA75 395 aa17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms