RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429285.6

NCOR2-208, Transcript of nuclear receptor corepressor 2, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NCOR2, Length 8,475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCOR2-208	ENST00000429285	DNAJA2	O60884	412 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	HLA-DQA2	P01906	255 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	HAL	P42357	657 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	EFR3A	Q14156	821 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	ZNF276	Q8N554	614 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	USP18	Q9UMW8	372 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	SMCO3	A2RU48	225 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	DHFR	P00374	187 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	BGN	P21810	368 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	GALNT3	Q14435	633 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	PP2D1	A8MPX8	630 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	PGK1	P00558	417 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	ITGA4	P13612	1032 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	ALDH9A1	P49189	494 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	MEIOB	Q8N635	442 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	SSR3	Q9UNL2	185 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	SLIT1	O75093	1534 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	MATN2	O00339	956 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	GP5	P40197	560 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	PLCL1	Q15111	1095 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	PPL	O60437	1756 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	KIF28P	B7ZC32	967 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	OXCT1	P55809	520 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	MGAT5	Q09328	741 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	DGCR6	Q14129	220 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	AAGAB	Q6PD74	315 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	CARNS1	A5YM72	827 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	ATF6	P18850	670 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	OMP	P47874	163 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	CUL2	Q13617	745 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	BBS4	Q96RK4	519 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	HACD1	B0YJ81	288 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	LRPAP1	P30533	357 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	NRG3	P56975	720 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	MED24	O75448	989 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	PSMG1	O95456	288 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	EGFR	P00533	1210 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	UMPS	P11172	480 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	MAGEA2	P43356	314 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285		F5H6K3	240 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	RENBP	P51606	427 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	KLRC3	Q07444	240 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	EMC2	Q15006	297 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	ZFP69	Q49AA0	526 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	ACOX2	Q99424	681 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	ALDH3A2	P51648	485 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	STK40	Q8N2I9	435 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	EMC1	Q8N766	993 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	SPEF2	Q9C093	1822 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285		H7C4K7	107 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	UNC5C	O95185	931 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	PI16	Q6UXB8	463 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	TBCB	Q99426	244 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	ACADVL	P49748	655 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	DDIT4	Q9NX09	232 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	CYP7B1	O75881	506 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NCOR2-208	ENST00000429285	ABHD2	P08910	425 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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