RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 C10orf120Q5SQS8 335 aa23.75■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 MSANTD2Q6P1R3 559 aa23.75■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 ANKS3Q6ZW76 656 aa23.75■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 OTOP3Q7RTS5 596 aa23.75■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 ARHGAP18Q8N392 663 aa23.75■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 BANPQ8N9N5 519 aa23.75■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC197Q8NCU1 140 aa23.75■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 SPPL2BQ8TCT7 592 aa23.75■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 DPF3Q92784 378 aa23.75■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 SLC39A13Q96H72 371 aa23.75■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 TEKT5Q96M29 485 aa23.75■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa23.75■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 IL37Q9NZH6 218 aa23.75■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 SLC17A7Q9P2U7 560 aa23.75■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 MICAL3Q7RTP6 2002 aa23.75■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 FAM159BA6NKW6 160 aa23.75■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 KIAA0754O94854 1291 aa23.75■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 ADRA1DP25100 572 aa23.75■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 HHATQ5VTY9 493 aa23.75■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 CNTD1Q8N815 330 aa23.75■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 BEGAINQ9BUH8 593 aa23.75■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP23.75■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa23.75■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 GSTA2P09210 222 aa23.74■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 SLC18A1P54219 525 aa23.74■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 DNAJC3Q13217 504 aa23.74■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa23.74■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 DNAAF3Q8N9W5 541 aa23.74■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 MOCS1Q9NZB8 636 aa23.74■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 TRHDEQ9UKU6 1024 aa23.74■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 FAM92AA1XBS5 289 aa23.73■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 H7C4K7 107 aa23.73■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 CRYMQ14894 314 aa23.73■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 FAM117BQ6P1L5 589 aa23.73■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 FBXO22Q8NEZ5 403 aa23.73■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 VN1R3Q9BXE9 311 aa23.73■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 WDR91A4D1P6 747 aa23.73■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 MYO1CO00159 1063 aa23.73■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 CCNB1P14635 433 aa23.73■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 ATF6P18850 670 aa23.73■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 COG7P83436 770 aa23.73■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 STEAP4Q687X5 459 aa23.73■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa23.73■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 CCSER2Q9H7U1 834 aa23.73■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 SNX3O60493 162 aa23.72■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 MAFKO60675 156 aa23.72■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 LPXNO60711 386 aa23.72■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 KRT37O76014 449 aa23.72■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 ZWINTO95229 277 aa23.72■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 PGAM1P18669 254 aa23.72■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 KCTD11Q693B1 232 aa23.72■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 VAT1Q99536 393 aa23.72■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 MARCH2Q9P0N8 246 aa23.72■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 GGA2Q9UJY4 613 aa23.72■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 GREB1Q4ZG55 1949 aa23.72■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 OR1D2P34982 312 aa23.72■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 CORO7P57737 925 aa23.72■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 MS4A13Q5J8X5 152 aa23.72■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 MROH9Q5TGP6 573 aa23.72■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 SH2D5Q6ZV89 423 aa23.72■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 OTUD6BQ8N6M0 293 aa23.72■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 SPATA22Q8NHS9 363 aa23.72■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 CLIC5Q9NZA1 410 aa23.72■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF180Q9UJW8 692 aa23.72■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa23.71■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 SUN1O94901 812 aa23.71■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 VWCEQ96DN2 955 aa23.71■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa23.71■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa23.71■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 SLC12A8A0AV02 714 aa23.71■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 HMX2A2RU54 273 aa23.71■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 CNTN5O94779 1100 aa23.71■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 SLC2A3P11169 496 aa23.71■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 TPH1P17752 444 aa23.71■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 CCNCP24863 283 aa23.71■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 IKBKEQ14164 716 aa23.71■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 CERCAMQ5T4B2 595 aa23.71■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 CGB2Q6NT52 195 aa23.71■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 ANKS4BQ8N8V4 417 aa23.71■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 SPATA17Q96L03 361 aa23.71■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
FAAP20-209ENST00000428120 ATP9BO43861 1147 aa23.7■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 HTR7P34969 479 aa23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms