RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 CROCCP3Q8IVE0 287 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.053e-9■■■■■ 44.8
PTPRU-204ENST00000428026 C1orf50Q9BV19 199 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ABCB10Q9NRK6 738 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 VAPBO95292 243 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 LSM8O95777 96 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 AMPD1P23109 780 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 FNIP1Q8TF40 1166 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF606Q8WXB4 792 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 TPP1O14773 563 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 PGAM1P18669 254 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF484Q5JVG2 852 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 SLC35C1Q96A29 364 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 PNMA5Q96PV4 448 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 MRIQ9BWK5 157 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 SH3BP4Q9P0V3 963 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 KCNK1O00180 336 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 QPCTQ16769 361 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 RNF43Q68DV7 783 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF470Q6ECI4 717 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 MPZL3Q6UWV2 235 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ILDR2Q71H61 639 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 CD302Q8IX05 232 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 DPP10Q8N608 796 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 SCUBE2Q9NQ36 999 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 PLA2G4CQ9UP65 541 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 CENPXA8MT69 81 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 H3BN98 237 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 STAG3L1P0CL83 205 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 NPY2RP49146 381 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 INHBEP58166 350 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 METTL7BQ6UX53 244 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 DHDDSQ86SQ9 333 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ARL10Q8N8L6 244 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 FBXO30Q8TB52 745 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 SOCS4Q8WXH5 440 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 GORASP1Q9BQQ3 440 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 NMRAL1Q9HBL8 299 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 TMEM165Q9HC07 324 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 RAD18Q9NS91 495 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 RAD51BO15315 384 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ASS1P00966 412 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 KRT6BP04259 564 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 PNPLA4P41247 253 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 GRIA3P42263 894 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 KRT6CP48668 564 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 DGKZQ13574 1117 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ATG14Q6ZNE5 492 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 CYP2W1Q8TAV3 490 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 SLITRK1Q96PX8 696 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 TRPC4Q9UBN4 977 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ERVK-10P10266 1014 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ATP6V1C1P21283 382 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 NEK10Q6ZWH5 1172 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 FBXO39Q8N4B4 442 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 CPNE1Q99829 537 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 NUAK2Q9H093 628 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 VPS45Q9NRW7 570 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ZMYM5Q9UJ78 669 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 FMN2Q9NZ56 1722 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 A8MUI8 341 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 FAM220BPB1ANY3 271 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 AKR1A1P14550 325 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 NAMPTP43490 491 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 BCAT1P54687 386 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 SRP54P61011 504 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 CASP12Q6UXS9 341 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 SETD9Q8NE22 299 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 FAM81AQ8TBF8 368 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 HTR3CQ8WXA8 447 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 NMRK1Q9NWW6 199 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 BTBD3Q9Y2F9 522 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 SALL3Q9BXA9 1300 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 GPR182O15218 404 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 MAP3K13O43283 966 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 CHKAP35790 457 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 NOGQ13253 232 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ACP6Q9NPH0 428 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-204ENST00000428026 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms