RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZFP69BQ9UJL9 534 aa19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NUMBLQ9Y6R0 609 aa19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARHGAP42A6NI28 874 aa19.14■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TPP1O14773 563 aa19.14■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EOMESO95936 686 aa19.14■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ITGA2BP08514 1039 aa19.14■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SP3Q02447 781 aa19.14■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF33AQ06730 810 aa19.14■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BST1Q10588 318 aa19.14■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MBTPS1Q14703 1052 aa19.14■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa19.14■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC24A5Q71RS6 500 aa19.14■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 E2F7Q96AV8 911 aa19.14■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HAPLN3Q96S86 360 aa19.14■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRPV6Q9H1D0 765 aa19.14■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRMDAQ9H2I8 198 aa19.14■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa19.14■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MSI1O43347 362 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 JCHAINP01591 159 aa19.13■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 T-ENOLP0DO92 83 aa19.13■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARFIP2P53365 341 aa19.13■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMPRSS15P98073 1019 aa19.13■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RIPK1Q13546 671 aa19.13■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHI3L2Q15782 390 aa19.13■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC39A12Q504Y0 691 aa19.13■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CES4AQ5XG92 561 aa19.13■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATG16L1Q676U5 607 aa19.13■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLNKQ7Z7G1 428 aa19.13■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SCD5Q86SK9 330 aa19.13■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM135Q86UB9 458 aa19.13■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NUDCD3Q8IVD9 361 aa19.13■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LINC01599Q8WXQ3 324 aa19.13■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CASP10Q92851 521 aa19.13■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C7orf26Q96N11 449 aa19.13■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa19.13■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HAO1Q9UJM8 370 aa19.13■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa19.13■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BIRC5O15392 142 aa19.13■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PAGE1O75459 146 aa19.13■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BPGMP07738 259 aa19.13■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HOXC13P31276 330 aa19.13■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCR1P32246 355 aa19.13■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COG7P83436 770 aa19.13■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa19.13■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GLT1D1Q96MS3 346 aa19.13■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM237Q96Q45 408 aa19.13■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TXNDC16Q9P2K2 825 aa19.13■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TTC3P53804 2025 aa19.12■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 USP1O94782 785 aa19.12■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GP5P40197 560 aa19.12■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NOMO2Q5JPE7 1267 aa19.12■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STXBP5Q5T5C0 1151 aa19.12■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MANEALQ5VSG8 457 aa19.12■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COLGALT2Q8IYK4 626 aa19.12■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP19.12■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CPNE1Q99829 537 aa19.12■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa19.12■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NMUR1Q9HB89 426 aa19.12■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NOD2Q9HC29 1040 aa19.12■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HEY2Q9UBP5 337 aa19.12■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa19.12■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa19.12■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa19.12■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DFFAO00273 331 aa19.12■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GLRA3O75311 464 aa19.12■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OAZ2O95190 189 aa19.12■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CBX6O95503 412 aa19.12■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OCRLQ01968 901 aa19.12■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CTC1Q2NKJ3 1217 aa19.12■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CERCAMQ5T4B2 595 aa19.12■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa19.12■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SCN4BQ8IWT1 228 aa19.12■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa19.12■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CNTD1Q8N815 330 aa19.12■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 INPP5DQ92835 1189 aa19.12■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TSGA13Q96PP4 275 aa19.12■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 APOL2Q9BQE5 337 aa19.12■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EMCNQ9ULC0 261 aa19.12■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STK38LQ9Y2H1 464 aa19.12■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCNCP24863 283 aa19.11■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HTR7P34969 479 aa19.11■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDE1BQ01064 536 aa19.11■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPP2R5DQ14738 602 aa19.11■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa19.11■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARTNQ5T4W7 220 aa19.11■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATPAF2Q8N5M1 289 aa19.11■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 URGCPQ8TCY9 931 aa19.11■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SKA1Q96BD8 255 aa19.11■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SAR1AQ9NR31 198 aa19.11■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TBC1D13Q9NVG8 400 aa19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms