RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414253.5

FAAP20-206, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,216 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-206ENST00000414253 UNC5BQ8IZJ1 945 aa25.12■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 GDPD5Q8WTR4 605 aa25.12■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa25.12■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 TOMM70O94826 608 aa25.12■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 TKTP29401 623 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 AQP4P55087 323 aa25.12■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 GBE1Q04446 702 aa25.12■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 PACS1Q6VY07 963 aa25.12■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 CDKL2Q92772 493 aa25.12■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 PNPOQ9NVS9 261 aa25.12■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 MTMR10Q9NXD2 777 aa25.12■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 AP4E1Q9UPM8 1137 aa25.12■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 WDR27A2RRH5 827 aa25.11■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 OPHN1O60890 802 aa25.11■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 PEX2P28328 305 aa25.11■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 RPL26P61254 145 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 ATG14Q6ZNE5 492 aa25.11■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 RSPH3Q86UC2 560 aa25.11■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 OSTM1Q86WC4 334 aa25.11■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 C10orf107Q8IVU9 208 aa25.11■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 NME8Q8N427 588 aa25.11■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 TNIP3Q96KP6 325 aa25.11■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 HAPLN3Q96S86 360 aa25.11■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 DNAI2Q9GZS0 605 aa25.11■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 SLC17A6Q9P2U8 582 aa25.11■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 POMPQ9Y244 141 aa25.11■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa25.11■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP25.11■■□□□ 1.613e-6■■■■■ 109.1
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FAAP20-206ENST00000414253 VCLP18206 1134 aa25.1■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa25.1■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 KATNAL1Q9BW62 490 aa25.1■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 CYP4F11Q9HBI6 524 aa25.1■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 Q9Y3F1 56 aa25.1■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF195O14628 629 aa25.1■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 ITGAXP20702 1163 aa25.1■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 SLC5A9Q2M3M2 681 aa25.1■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa25.1■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 KCNT2Q6UVM3 1135 aa25.1■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 CCDC185Q8N715 623 aa25.1■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 PRKCGP05129 697 aa25.09■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 MLNP12872 115 aa25.09■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 WARSP23381 471 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
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FAAP20-206ENST00000414253 DEUP1Q05D60 604 aa25.09■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 INSCQ1MX18 579 aa25.09■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 CASC4Q6P4E1 433 aa25.09■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 DEFB107AQ8IZN7 70 aa25.09■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 TOP6BLQ8N6T0 577 aa25.09■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 PTGESO14684 152 aa25.09■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 HOXC8P31273 242 aa25.09■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 SAPCD2Q86UD0 394 aa25.09■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 PIGZQ86VD9 579 aa25.09■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 CSPG4P5Q96PW8 444 aa25.09■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa25.09■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 COPG2Q9UBF2 871 aa25.09■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa25.09■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 ARRB2P32121 409 aa25.08■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 SERPINB6P35237 376 aa25.08■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 HARS2P49590 506 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 PURAQ00577 322 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 DLG1Q12959 904 aa25.08■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 NAB1Q13506 487 aa25.08■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 TRIP10Q15642 601 aa25.08■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 STRADAQ7RTN6 431 aa25.08■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 FBXW8Q8N3Y1 598 aa25.08■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 A0A1B0GVG6 124 aa25.08■■□□□ 1.6
FAAP20-206ENST00000414253 ITGA2BP08514 1039 aa25.08■■□□□ 1.6
FAAP20-206ENST00000414253 RAG1P15918 1043 aa25.08■■□□□ 1.6
FAAP20-206ENST00000414253 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
FAAP20-206ENST00000414253 LRPAP1P30533 357 aa25.08■■□□□ 1.6
FAAP20-206ENST00000414253 MATKP42679 507 aa25.08■■□□□ 1.6
FAAP20-206ENST00000414253 LAMB3Q13751 1172 aa25.08■■□□□ 1.6
FAAP20-206ENST00000414253 MMEL1Q495T6 779 aa25.08■■□□□ 1.6
FAAP20-206ENST00000414253 HPS6Q86YV9 775 aa25.08■■□□□ 1.6
FAAP20-206ENST00000414253 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa25.08■■□□□ 1.6
FAAP20-206ENST00000414253 ZFP42Q96MM3 310 aa25.08■■□□□ 1.6
FAAP20-206ENST00000414253 DUSP16Q9BY84 665 aa25.08■■□□□ 1.6
FAAP20-206ENST00000414253 PEX1O43933 1283 aa25.07■■□□□ 1.6
FAAP20-206ENST00000414253 RALBP11234 206 aa25.07■■□□□ 1.6
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