RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399613.1

PAN3-202, Transcript of poly(A) specific ribonuclease subunit PAN3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PAN3, Length 4,940 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3-202ENST00000399613 ITGB7P26010 798 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 CSKP41240 450 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 MXI1P50539 228 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 ARSEP51690 589 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 E2F5Q15329 346 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 RAB6CQ53S08 254 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 ALG1LQ6GMV1 187 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 OGFOD3Q6PK18 319 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 PDZD3Q86UT5 571 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 ARRDC3Q96B67 414 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 BTN2A3PQ96KV6 586 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 HAPLN3Q96S86 360 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 TTYH3Q9C0H2 523 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 RAB6CQ9H0N0 254 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 PLCB1Q9NQ66 1216 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 FOXD4L1Q9NU39 408 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 PIGVQ9NUD9 493 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 EXOC1Q9NV70 894 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 TTC34A8MYJ7 566 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 SRCP12931 536 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 NCAPHQ15003 741 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 CST6Q15828 149 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 CDKN3Q16667 212 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 FATE1Q969F0 183 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 CDC6Q99741 560 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 USP29Q9HBJ7 922 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 NUDT5Q9UKK9 219 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 DMTF1Q9Y222 760 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 CER1O95813 267 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 VAV1P15498 845 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 ADORA2BP29275 332 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 PPP1R2P41236 205 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 CLCN6P51797 869 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 OVGP1Q12889 678 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 MTA1Q13330 715 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 NUGGCQ68CJ6 796 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 FBXL22Q6P050 247 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 TM7SF3Q9NS93 570 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 TACR2P21452 398 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 APBA1Q02410 837 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 LINC00303Q3SY05 128 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 SGO2Q562F6 1265 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 OR4C6Q8NH72 309 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 EPAS1Q99814 870 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 OSBPL2Q9H1P3 480 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 LRRC19Q9H756 370 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa5□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 SDK2Q58EX2 2172 aa4.99□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 TRIM38O00635 465 aa4.99□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 TOR1BO14657 336 aa4.99□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 SEMA4FO95754 770 aa4.99□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 ADH1BP00325 375 aa4.99□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 ITGB6P18564 788 aa4.99□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 CSNK1DP48730 415 aa4.99□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 RPS24P62847 133 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 TRPC3Q13507 836 aa4.99□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 WDR45BQ5MNZ6 344 aa4.99□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 PIGKQ92643 395 aa4.99□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 SLC6A18Q96N87 628 aa4.99□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 FUCA2Q9BTY2 467 aa4.99□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 MTG2Q9H4K7 406 aa4.99□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 THAP9Q9H5L6 903 aa4.99□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 ACP6Q9NPH0 428 aa4.99□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 PDP2Q9P2J9 529 aa4.99□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa4.99□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa4.99□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 ST14Q9Y5Y6 855 aa4.99□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 A0A1B0GVT2 93 aa4.99□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 CFAP69A5D8W1 941 aa4.99□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 KCNH2Q12809 1159 aa4.99□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 FZD2Q14332 565 aa4.99□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 IL31Q6EBC2 164 aa4.99□□□□□ -1.61
PAN3-202ENST00000399613 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms