RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 SLC39A12Q504Y0 691 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 TTMPQ5BVD1 217 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 AGBL2Q5U5Z8 902 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 FAM171A1Q5VUB5 890 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 IZUMO3Q5VZ72 239 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 SLC8B1Q6J4K2 584 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF280DQ6N043 979 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 NPNTQ6UXI9 565 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 C4orf22Q6V702 233 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 GSTA5Q7RTV2 222 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 CROCCP2Q86T23 111 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 PRUNE1Q86TP1 453 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 FAM131BQ86XD5 332 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 TP53INP2Q8IXH6 220 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 GPR65Q8IYL9 337 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF276Q8N554 614 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 SCAMP5Q8TAC9 235 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 RNF139Q8WU17 664 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 CPT1BQ92523 772 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 TOP1MTQ969P6 601 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 EXOC4Q96A65 974 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 TLCD1Q96CP7 247 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 HAUS1Q96CS2 278 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 SPATA17Q96L03 361 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 MAGEB5Q9BZ81 275 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 OSBPL2Q9H1P3 480 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 SEMA4AQ9H3S1 761 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 SMOC2Q9H3U7 446 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 ANLNQ9NQW6 1124 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 ABCC13Q9NSE7 274 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 DTLQ9NZJ0 730 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 HSFX1Q9UBD0 423 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 LRFN2Q9ULH4 789 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 BACE2Q9Y5Z0 518 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 LTBP2Q14767 1821 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 VWA8A3KMH1 1905 aa6.21□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 MTMR11A4FU01 709 aa6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 CARNS1A5YM72 827 aa6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 C5orf60A6NFR6 353 aa6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 KCNU1A8MYU2 1149 aa6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 SGK1O00141 431 aa6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 CAPN9O14815 690 aa6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 EFCAB14O75071 495 aa6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 GCATO75600 419 aa6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 PAPLNO95428 1278 aa6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 TIMP1P01033 207 aa6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 OR4Q2P0C623 313 aa6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 NCAM1P13591 858 aa6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 TSHRP16473 764 aa6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 GOT1P17174 413 aa6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 ARL4AP40617 200 aa6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 PGFP49763 221 aa6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 NRLP54845 237 aa6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 GBE1Q04446 702 aa6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 GPS1Q13098 491 aa6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 SLC29A2Q14542 456 aa6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 KCNJ11Q14654 390 aa6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 PPP2R5DQ14738 602 aa6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 RASA2Q15283 850 aa6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 LRRC26Q2I0M4 334 aa6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 SLC45A4Q5BKX6 768 aa6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 BRMS1LQ5PSV4 323 aa6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 RTP2Q5QGT7 225 aa6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 CEP85LQ5SZL2 805 aa6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 MANEALQ5VSG8 457 aa6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 DENND2CQ68D51 928 aa6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 MFSD5Q6N075 450 aa6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 TAC4Q86UU9 113 aa6.21□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 MON1AQ86VX9 555 aa6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.8 ms