RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394744.6

RAB11FIP4-201, Transcript of RAB11 family interacting protein 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RAB11FIP4, Length 1,968 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4-201ENST00000394744 VPS11Q9H270 941 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 KLHL14Q9P2G3 628 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MYO16Q9Y6X6 1858 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ARHGAP42A6NI28 874 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CCL5P13501 91 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CCNFP41002 786 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 NIPAL4Q0D2K0 466 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ZNF280DQ6N043 979 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CES3Q6UWW8 571 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 GPR152Q8TDT2 470 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SERPINB11Q96P15 392 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PLCD4Q9BRC7 762 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MARCH5Q9NX47 278 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 GMIPQ9P107 970 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 KCNU1A8MYU2 1149 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 H0YHG0 523 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MAGEA11P43364 429 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SLC11A1P49279 550 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ARPP19P56211 112 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 USP33Q8TEY7 942 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 APBB2Q92870 758 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 DEFB118Q96PH6 123 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FBXO44Q9H4M3 255 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CASS4Q9NQ75 786 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 LRFN2Q9ULH4 789 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 HS3ST4Q9Y661 456 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 VWA8A3KMH1 1905 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TTC3P53804 2025 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SOAT2O75908 522 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ALDH2P05091 517 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 HTR7P34969 479 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 RNF43Q68DV7 783 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 OTOAQ7RTW8 1153 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 C14orf80Q86SX3 495 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ATPAF2Q8N5M1 289 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SEPT8Q92599 483 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CDKL2Q92772 493 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PTPRN2Q92932 1015 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MANSC1Q9H8J5 431 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 NDFIP2Q9NV92 336 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 VANGL2Q9ULK5 521 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 OR6C75A6NL08 312 aa20.33■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 UBOX5O94941 541 aa20.33■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 POLBP06746 335 aa20.33■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FGFR3P22607 806 aa20.33■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TUBP50607 506 aa20.33■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ZNF33AQ06730 810 aa20.33■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MSANTD2Q6P1R3 559 aa20.33■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CHSY1Q86X52 802 aa20.33■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CNTD1Q8N815 330 aa20.33■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 DNAAF3Q8N9W5 541 aa20.33■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TSGA13Q96PP4 275 aa20.33■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SLC39A8Q9C0K1 460 aa20.33■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 RNF208Q9H0X6 261 aa20.33■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa20.33■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SLC12A4Q9UP95 1085 aa20.33■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 NUP205Q92621 2012 aa20.33■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 E9PAM4 449 aa20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CPB1P15086 417 aa20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CCNCP24863 283 aa20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PBX3P40426 434 aa20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SPANXN3Q5MJ09 141 aa20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PACS1Q6VY07 963 aa20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 OTOP3Q7RTS5 596 aa20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 APOL2Q9BQE5 337 aa20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SLC13A1Q9BZW2 595 aa20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 LRRC40Q9H9A6 602 aa20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PCMTD2Q9NV79 361 aa20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 HAUS2Q9NVX0 235 aa20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 UBP1Q9NZI7 540 aa20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 BFARQ9NZS9 450 aa20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MPP6Q9NZW5 540 aa20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TLR6Q9Y2C9 796 aa20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 GSTA1P08263 222 aa20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FUT10Q6P4F1 479 aa20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 RASSF3Q86WH2 238 aa20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ARHGAP18Q8N392 663 aa20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 LZTR1Q8N653 840 aa20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FITM2Q8N6M3 262 aa20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SLC39A13Q96H72 371 aa20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MKS1Q9NXB0 559 aa20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 IL37Q9NZH6 218 aa20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PLLPQ9Y342 182 aa20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PSAT1Q9Y617 370 aa20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SHROOM3Q8TF72 1996 aa20.31■□□□□ 0.84
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PITPNM1O00562 1244 aa20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms