RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 TXNL1O43396 289 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 PDE8BO95263 885 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 PGM3O95394 542 aa6.97□□□□□ -1.29
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RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
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RABGEF1-202ENST00000380828 UVRAGQ9P2Y5 699 aa6.97□□□□□ -1.29
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RABGEF1-202ENST00000380828 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
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RABGEF1-202ENST00000380828 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
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RABGEF1-202ENST00000380828 C10orf71Q711Q0 1435 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 SRGAP2O75044 1071 aa6.96□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 TRIM16O95361 564 aa6.96□□□□□ -1.29
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