RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 CENPCQ03188 943 aa24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 C2CD6Q53TS8 623 aa24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 XYLT1Q86Y38 959 aa24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 VANGL2Q9ULK5 521 aa24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 PAGE1O75459 146 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 CEACAM1P13688 526 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 STK19P49842 368 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 SULT1E1P49888 294 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 SEMA3BQ13214 749 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 SLC12A1Q13621 1099 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 ARID5BQ14865 1188 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 C9orf64Q5T6V5 341 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 C14orf80Q86SX3 495 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 HDDC3Q8N4P3 179 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 BTBD1Q9H0C5 482 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 PCED1AQ9H1Q7 454 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 ANLNQ9NQW6 1124 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 ITIH6Q6UXX5 1313 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 OPHN1O60890 802 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 ADCY5O95622 1261 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 CXCR3P49682 368 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 FMO1Q01740 532 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 NAA35Q5VZE5 725 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 PIP4P1Q86T03 277 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 OR52K2Q8NGK3 314 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 SLC20A1Q8WUM9 679 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 CPA5Q8WXQ8 436 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 NT5C3BQ969T7 300 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 SIK2Q9H0K1 926 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 ACACBO00763 2458 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 A0A1B0GTH6 734 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 GOLGA8SH3BPF8 625 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 I6L893 689 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 SEMA4FO95754 770 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 FERP16591 822 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 MMP8P22894 467 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 PLK1P53350 603 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 GRIK2Q13002 908 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 BRMS1LQ5PSV4 323 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 TRNP1Q6NT89 227 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 C1orf216Q8TAB5 229 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 SNX19Q92543 992 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 ALG14Q96F25 216 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 FAM129BQ96TA1 746 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 TBCBQ99426 244 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 EDEM3Q9BZQ6 932 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 TKTL2Q9H0I9 626 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 WDCPQ9H6R7 721 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 SNX10Q9Y5X0 201 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-201ENST00000378543 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 UPK3BL1B0FP48 263 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 UPK3BL2E5RIL1 263 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 FLT3P36888 993 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 DEUP1Q05D60 604 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 CST6Q15828 149 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 SLC25A52Q3SY17 297 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 C5orf22Q49AR2 442 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 PTPRN2Q92932 1015 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 SGK2Q9HBY8 427 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 FBXL12Q9NXK8 326 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 SERGEFQ9UGK8 458 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 MID1O15344 667 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 TEX33O43247 280 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 GJB3O75712 270 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 SERPINC1P01008 464 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 UNGP13051 313 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 CD59P13987 128 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 CHRNB2P17787 502 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 NSFP46459 744 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 OXCT1P55809 520 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 GSCP56915 257 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 USP30Q70CQ3 517 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 STK40Q8N2I9 435 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 GANCQ8TET4 914 aa24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms