RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376959.6

KCNC3-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene KCNC3, Length 5,447 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3-201ENST00000376959 SLC25A3Q00325 362 aa22.7■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 ZNF621Q6ZSS3 439 aa22.7■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 BHMTQ93088 406 aa22.7■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.7■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 TINF2Q9BSI4 451 aa22.7■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa22.7■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 H7C4K7 107 aa22.69■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 KRT36O76013 467 aa22.69■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 FGFR2P21802 821 aa22.69■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa22.69■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 IDH2P48735 452 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa22.69■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 PHACTR4Q8IZ21 702 aa22.69■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 COLEC11Q9BWP8 271 aa22.69■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 NUDT5Q9UKK9 219 aa22.69■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.69■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.69■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 VAPBO95292 243 aa22.69■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 STAG3L1P0CL83 205 aa22.69■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 SREBF1P36956 1147 aa22.69■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 GRIA3P42263 894 aa22.69■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 FBXO30Q8TB52 745 aa22.69■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 TBCDQ9BTW9 1192 aa22.69■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 DNAJC18Q9H819 358 aa22.69■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 ATXN10Q9UBB4 475 aa22.69■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 DNPEPQ9ULA0 475 aa22.69■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 CCDC162PA2VCL2 907 aa22.69■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 HAT1O14929 419 aa22.69■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 KCNJ2P63252 427 aa22.69■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 FCHO2Q0JRZ9 810 aa22.69■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 MFSD7Q6UXD7 560 aa22.69■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 POMGNT2Q8NAT1 580 aa22.69■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 UPP2O95045 317 aa22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 COX4I1P13073 169 aa22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 RENBPP51606 427 aa22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 ZNF484Q5JVG2 852 aa22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 ZNF554Q86TJ5 538 aa22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 DNAAF5Q86Y56 855 aa22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 OSBPL11Q9BXB4 747 aa22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 LRG1P02750 347 aa22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 MTTPP55157 894 aa22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 ABATP80404 500 aa22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 SQLEQ14534 574 aa22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 GATAD2AQ86YP4 633 aa22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 HIPK1Q86Z02 1210 aa22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 GIPC3Q8TF64 312 aa22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 Q96MT0 163 aa22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 GMPPBQ9Y5P6 360 aa22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 TRIM38O00635 465 aa22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 B3GAT3O94766 335 aa22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 DBTP11182 482 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 LHX1P48742 406 aa22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 SCNN1BP51168 640 aa22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 XIAPP98170 497 aa22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 NFIXQ14938 502 aa22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 ACAP1Q15027 740 aa22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 LPCAT1Q8NF37 534 aa22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 APBA2Q99767 749 aa22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 PRDM4Q9UKN5 801 aa22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 LTFP02788 710 aa22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 EFEMP1Q12805 493 aa22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 MED8Q96G25 268 aa22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 CLN6Q9NWW5 311 aa22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 ENTPD5O75356 428 aa22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 ICAM1P05362 532 aa22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 HGH1Q9BTY7 390 aa22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 DSEQ9UL01 958 aa22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa22.67■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 RHAGQ02094 409 aa22.67■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 ST3GAL1Q11201 340 aa22.67■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 COMMD2Q86X83 199 aa22.67■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 PALB2Q86YC2 1186 aa22.67■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 UCMAQ8WVF2 138 aa22.67■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 VPS45Q9NRW7 570 aa22.67■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 ZNF222Q9UK12 451 aa22.67■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 SLC12A8A0AV02 714 aa22.67■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 MAPTP10636 758 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 TKTL1P51854 596 aa22.67■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 SPAG4Q9NPE6 437 aa22.67■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa22.67■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 DMTF1Q9Y222 760 aa22.67■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.67■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 TMCC2O75069 709 aa22.67■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 PSME3P61289 254 aa22.67■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 PYDC2Q56P42 97 aa22.67■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 AAGABQ6PD74 315 aa22.67■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 MREGQ8N565 214 aa22.67■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 BORCS5Q969J3 196 aa22.67■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 CDHR5Q9HBB8 845 aa22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms