RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 TPGS1Q6ZTW0 290 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 THAP11Q96EK4 314 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 SIKE1Q9BRV8 207 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 CTNNB1P35222 781 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 SMARCB1Q12824 385 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 MFSD4BQ5TF39 518 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 CES3Q6UWW8 571 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 SCUBE1Q8IWY4 988 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 PHF21AQ96BD5 680 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 SERAC1Q96JX3 654 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 RAD18Q9NS91 495 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 KCND1Q9NSA2 647 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 PCYOX1Q9UHG3 505 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 STAU1O95793 577 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 APOA1P02647 267 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 ICAM3P32942 547 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC1A6P48664 564 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 AGKQ53H12 422 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM35AQ86V20 835 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 TBC1D3BA6NDS4 549 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 LIASO43766 372 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 GUCA1CO95843 209 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 INPP5DQ92835 1189 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 SKA1Q96BD8 255 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 STARD13Q9Y3M8 1113 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNA3P22001 575 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 PSMB4P28070 264 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 FAAP100Q0VG06 881 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 PGS1Q32NB8 556 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 MTSS1LQ765P7 747 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 DUSP16Q9BY84 665 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 DPY30Q9C005 99 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 CDHR5Q9HBB8 845 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 TMCC3Q9ULS5 477 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 DAB1O75553 588 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 FGFR1P11362 822 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 NQO1P15559 274 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 NME5P56597 212 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIM69Q86WT6 500 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 OSCP1Q8WVF1 389 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 IGFLR1Q9H665 355 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 CALCAP01258 141 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC2A4P14672 509 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 SPPL2BQ8TCT7 592 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 WNT7AO00755 349 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 KATNA1O75449 491 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM153BP0C7A2 387 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 CORO7P57737 925 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 MMRN1Q13201 1228 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM153CQ494X1 144 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 KRT78Q8N1N4 520 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 PRDM12Q9H4Q4 367 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRC19Q9H756 370 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 CATSPERZQ9NTU4 200 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 ZBTB14O43829 449 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 C9orf57Q5W0N0 161 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 SPRYD7Q5W111 196 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 RIN3Q8TB24 985 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 METTL6Q8TCB7 284 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 CAPN10Q9HC96 672 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 PLIN4Q96Q06 1357 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 NFAT5O94916 1531 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A087X1B8 175 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 BTN3A1O00481 513 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 BAIAP3O94812 1187 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 CCNB1P14635 433 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 TSHRP16473 764 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 AIF1P55008 147 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 RUNX1T1Q06455 604 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 MON1AQ86VX9 555 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 PLD3Q8IV08 490 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 NKX2-3Q8TAU0 364 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 DEFB118Q96PH6 123 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 CATP04040 527 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms