RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 CCR3P51677 355 aa27.5■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 PLEKHG6Q3KR16 790 aa27.5■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 PITRM1Q5JRX3 1037 aa27.5■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 POLNQ7Z5Q5 900 aa27.5■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 NLRP14Q86W24 1093 aa27.5■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 C1orf210Q8IVY1 113 aa27.5■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 IL17RCQ8NAC3 791 aa27.5■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 PRRX2Q99811 253 aa27.5■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 FEM1AQ9BSK4 669 aa27.5■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP27.5■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF212Q9UDV6 495 aa27.5■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 NEU3Q9UQ49 428 aa27.5■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 WASH4PA8MWX3 477 aa27.49■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 DAPK3O43293 454 aa27.49■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 ASLP04424 464 aa27.49■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 ARL4AP40617 200 aa27.49■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 CSKP41240 450 aa27.49■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 CXCL12P48061 93 aa27.49■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 SULT2A1Q06520 285 aa27.49■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 FUT11Q495W5 492 aa27.49■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 EOGTQ5NDL2 527 aa27.49■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa27.49■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 SYT13Q7L8C5 426 aa27.49■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 TPCN2Q8NHX9 752 aa27.49■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 TSGA10Q9BZW7 698 aa27.49■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 MUC3BQ9H195 1237 aa27.49■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 SALL4Q9UJQ4 1053 aa27.49■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 ALG6Q9Y672 507 aa27.49■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 LAMTOR5O43504 91 aa27.48■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 DLDP09622 509 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 COMTP21964 271 aa27.48■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 NTSR1P30989 418 aa27.48■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 ETFBP38117 255 aa27.48■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 TAS2R40P59535 323 aa27.48■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 LRRC38Q5VT99 294 aa27.48■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa27.48■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 C11orf63Q6NUN7 778 aa27.48■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 RFX8Q6ZV50 586 aa27.48■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 MAP7D3Q8IWC1 876 aa27.48■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 APCDD1Q8J025 514 aa27.48■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 ALLCQ8N6M5 410 aa27.48■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 HCN2Q9UL51 889 aa27.48■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 MMP17Q9ULZ9 603 aa27.48■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 H3BRJ5 948 aa27.47■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 BUB1O43683 1085 aa27.47■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 SPOPO43791 374 aa27.47■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC175P0C221 793 aa27.47■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 KRT81Q14533 505 aa27.47■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 PDK2Q15119 407 aa27.47■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 DAAM2Q86T65 1068 aa27.47■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 CPNE8Q86YQ8 564 aa27.47■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 RHOT1Q8IXI2 618 aa27.47■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 CHPFQ8IZ52 775 aa27.47■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC33Q8N5R6 958 aa27.47■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 KCTD6Q8NC69 237 aa27.47■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 ALG14Q96F25 216 aa27.47■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 MAGEH1Q9H213 219 aa27.47■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 DNAI1Q9UI46 699 aa27.47■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 VPS28Q9UK41 221 aa27.47■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 OR51B4Q9Y5P0 310 aa27.47■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 ANTXRLA6NF34 631 aa27.46■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 KRT86O43790 486 aa27.46■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 GOT1P17174 413 aa27.46■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 CDH6P55285 790 aa27.46■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 ECT2LQ008S8 904 aa27.46■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa27.46■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 PKN3Q6P5Z2 889 aa27.46■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 OR52K2Q8NGK3 314 aa27.46■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 FAM71BQ8TC56 605 aa27.46■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 PCDH18Q9HCL0 1135 aa27.46■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 SLC8A2Q9UPR5 921 aa27.46■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 GJC1P36383 396 aa27.45■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 ST8SIA6P61647 398 aa27.45■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 GNA12Q03113 381 aa27.45■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF234Q14588 700 aa27.45■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa27.45■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 KDM1BQ8NB78 822 aa27.45■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 KIAA1524Q8TCG1 905 aa27.45■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 SORCS1Q8WY21 1168 aa27.45■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.99
CRIP1-201ENST00000330233 NNMTP40261 264 aa27.44■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 ENPP2Q13822 863 aa27.44■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF662Q6ZS27 426 aa27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms