RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329078.7

SPNS2-201, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS2, Length 3,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-201ENST00000329078 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 SMPD1P17405 629 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 TAZQ16635 292 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 SLC9A4Q6AI14 798 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 ANKRD52Q8NB46 1076 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF398Q8TD17 642 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 LPPQ93052 612 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 TASP1Q9H6P5 420 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 CHRAC1Q9NRG0 131 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 GJD2Q9UKL4 321 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 PDHXO00330 501 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 DHRS4L1P0CG22 281 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 FUT4P22083 530 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 TMEM110Q86TL2 294 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 GDPD5Q8WTR4 605 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 TSNARE1Q96NA8 513 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 SLC4A5Q9BY07 1137 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 FAM200BP0CF97 657 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 CPA3P15088 417 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 POU5F1BQ06416 359 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 INCA1Q0VD86 236 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF460Q14592 562 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 OR6Y1Q8NGX8 325 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 CXorf38Q8TB03 319 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 CNBD2Q96M20 576 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 OMDQ99983 421 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 MROH8Q9H579 483 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 CASTOR2A6NHX0 329 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 PEX1O43933 1283 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 ERCC2P18074 760 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 CCNA1P78396 465 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 MAP7Q14244 749 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 POU6F1Q14863 301 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 SPDYAQ5MJ70 313 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 HPS6Q86YV9 775 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 IFT43Q96FT9 208 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 C16orf70Q9BSU1 422 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 TAF6P49848 677 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 DGKDQ16760 1214 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 PDPK2PQ6A1A2 396 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 ZBTB46Q86UZ6 589 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 PHTF2Q8N3S3 785 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 TMEM40Q8WWA1 233 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 APBA2Q99767 749 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 MTMR10Q9NXD2 777 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 GARSP41250 739 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 SERPINB9P50453 376 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 COPAP53621 1224 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 ITKQ08881 620 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 PCSK7Q16549 785 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 IPMKQ8NFU5 416 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 PIGVQ9NUD9 493 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 BLOC1S6Q9UL45 172 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 SSC5DA1L4H1 1573 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 A0A096LPK6 155 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 ENDOD1O94919 500 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 PRKCHP24723 683 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 GRM5P41594 1212 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 GRIA2P42262 883 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 TAPT1Q6NXT6 567 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 SNX31Q8N9S9 440 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 ZFAND2BQ8WV99 257 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 SNX15Q9NRS6 342 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 CNTN3Q9P232 1028 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 TLK1Q9UKI8 766 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 VANGL2Q9ULK5 521 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 MAGEB3O15480 346 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 TREHO43280 583 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 ADCY6O43306 1168 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 AMHP03971 560 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 EPHA3P29320 983 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 CRHR1P34998 444 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 CYTH1Q15438 398 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 CCL15Q16663 113 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF778Q96MU6 729 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 TLE6Q9H808 572 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 FETUBQ9UGM5 382 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 STAP1Q9ULZ2 295 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 MDM4O15151 490 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 PMPCBO75439 489 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 SOX11P35716 441 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS2-201ENST00000329078 CDK7P50613 346 aa20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56 ms