RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297316.4

SOX17-201, Transcript of SRY-box 17, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOX17, Length 2,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17-201ENST00000297316 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
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SOX17-201ENST00000297316 PTPN3P26045 913 aa21.88■■□□□ 1.09
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SOX17-201ENST00000297316 CD68P34810 354 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
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SOX17-201ENST00000297316 UNC5BQ8IZJ1 945 aa21.84■■□□□ 1.09
SOX17-201ENST00000297316 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
SOX17-201ENST00000297316 SGSM3Q96HU1 749 aa21.84■■□□□ 1.09
SOX17-201ENST00000297316 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
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