RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280780.6

FAM53B-201, Transcript of family with sequence similarity 53 member B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM53B, Length 1,568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53B-201ENST00000280780 PAFAH1B1P43034 410 aa22.97■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 KAZNQ674X7 775 aa22.97■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 NLRP14Q86W24 1093 aa22.97■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 KIAA1958Q8N8K9 716 aa22.97■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 ECT2Q9H8V3 914 aa22.97■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa22.97■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 DCLK1O15075 740 aa22.97■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 ERCC2P18074 760 aa22.97■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 TARSP26639 723 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 IFNAR2P48551 515 aa22.97■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 PDGFRLQ15198 375 aa22.97■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 GAB4Q2WGN9 574 aa22.97■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa22.97■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 PLD5Q8N7P1 536 aa22.97■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 NDFIP2Q9NV92 336 aa22.97■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 TBC1D14Q9P2M4 693 aa22.97■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 FGGP02679 453 aa22.96■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 AOC1P19801 751 aa22.96■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 CTHP32929 405 aa22.96■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 HTR7P34969 479 aa22.96■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 CLCN5P51795 746 aa22.96■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 CCDC181Q5TID7 509 aa22.96■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa22.96■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 SLC9A4Q6AI14 798 aa22.96■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 RHBDF2Q6PJF5 856 aa22.96■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 LRRC31Q6UY01 552 aa22.96■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 TMEM25Q86YD3 366 aa22.96■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 RFX6Q8HWS3 928 aa22.96■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 ZYG11BQ9C0D3 744 aa22.96■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 LTB4R2Q9NPC1 389 aa22.96■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 EFR3BQ9Y2G0 817 aa22.96■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.27
FAM53B-201ENST00000280780 FAM170BA6NMN3 283 aa22.95■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 CST8O60676 142 aa22.95■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 GJA4P35212 333 aa22.95■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 CHKAP35790 457 aa22.95■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 DYNLT1P63172 113 aa22.95■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 UBXN2BQ14CS0 331 aa22.95■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 TPGS1Q6ZTW0 290 aa22.95■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 BBS12Q6ZW61 710 aa22.95■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa22.95■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 NPWQ8N729 165 aa22.95■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 SPATA4Q8NEY3 305 aa22.95■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 PJA1Q8NG27 643 aa22.95■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 FAM3CQ92520 227 aa22.95■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 UBXN4Q92575 508 aa22.95■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 BHMTQ93088 406 aa22.95■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 OTUB2Q96DC9 234 aa22.95■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 SHDQ96IW2 340 aa22.95■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 KLC2Q9H0B6 622 aa22.95■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa22.95■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 VPS13AQ96RL7 3174 aa22.94■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 RHOQP17081 205 aa22.94■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 FYB2Q5VWT5 728 aa22.94■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 RNF43Q68DV7 783 aa22.94■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 ZNF852Q6ZMS4 543 aa22.94■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 CCDC105Q8IYK2 499 aa22.94■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 NETO2Q8NC67 525 aa22.94■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 SIT1Q9Y3P8 196 aa22.94■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 MIA3Q5JRA6 1907 aa22.94■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 DAPK3O43293 454 aa22.93■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 TBL1XO60907 577 aa22.93■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 CYP17A1P05093 508 aa22.93■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 PON2Q15165 354 aa22.93■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 DHCR24Q15392 516 aa22.93■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa22.93■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 RABGAP1LQ5R372 815 aa22.93■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 LY6G5CQ5SRR4 150 aa22.93■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 NPNTQ6UXI9 565 aa22.93■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 TP53INP2Q8IXH6 220 aa22.93■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 MMGT1Q8N4V1 131 aa22.93■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 ATP2A3Q93084 1043 aa22.93■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 SPHK2Q9NRA0 654 aa22.93■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 TMEM248Q9NWD8 314 aa22.93■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 PLK2Q9NYY3 685 aa22.93■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 CLEC4EQ9ULY5 219 aa22.93■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 ANTXRLA6NF34 631 aa22.93■■□□□ 1.26
FAM53B-201ENST00000280780 WASH4PA8MWX3 477 aa22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms