RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258243.6

URB2-201, Transcript of URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene URB2, Length 5,613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URB2-201ENST00000258243 DCLRE1BQ9H816 532 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 SPASTQ9UBP0 616 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 SAC3D1A6NKF1 404 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 RARGP13631 454 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 ANKS6Q68DC2 871 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 ILDR2Q71H61 639 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 MYLPFQ96A32 169 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 HES6Q96HZ4 224 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 TTPALQ9BTX7 342 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 KRT84Q9NSB2 600 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 RPTORQ8N122 1335 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 ABCC6O95255 1503 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 A0A0U1RQJ8 604 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 NFAT5O94916 1531 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 MSL3P1P0C860 447 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 ZNF844Q08AG5 666 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 TTMPQ5BVD1 217 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 SLC24A5Q71RS6 500 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 GALNT4Q8N4A0 578 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 EXD1Q8NHP7 514 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 OSCP1Q8WVF1 389 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 EME1Q96AY2 570 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 NLNQ9BYT8 704 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 SCN3BQ9NY72 215 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 GRID1Q9ULK0 1009 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 AOC2O75106 756 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 CTSEP14091 401 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 SERPINB8P50452 374 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 THOP1P52888 689 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 INPP5AQ14642 412 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 C6orf10Q5SRN2 563 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 MCOLN2Q8IZK6 566 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 NUP93Q8N1F7 819 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 CXorf40AQ8TE69 158 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 LENG9Q96B70 501 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 HEY2Q9UBP5 337 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 PRELID1Q9Y255 219 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 C2CD2Q9Y426 696 aa11.1□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 PTPN7P35236 360 aa11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 MTM1Q13496 603 aa11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 NT5DC1Q5TFE4 455 aa11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 NT5DC3Q86UY8 548 aa11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 MICU2Q8IYU8 434 aa11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 ADAM32Q8TC27 787 aa11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 ANKRD27Q96NW4 1050 aa11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 TKTL2Q9H0I9 626 aa11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 KCTD10Q9H3F6 313 aa11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 RXFP1Q9HBX9 757 aa11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 KNDC1Q76NI1 1749 aa11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 UNCXA6NJT0 531 aa11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 ATP9AO75110 1047 aa11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 KLHL2O95198 593 aa11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 APOA4P06727 396 aa11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 ATP6V1B1P15313 513 aa11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 NPR3P17342 541 aa11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 HALP42357 657 aa11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 HSPA13P48723 471 aa11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 GTF2BQ00403 316 aa11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 LGALS3BPQ08380 585 aa11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 LRRC74AQ0VAA2 488 aa11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 CDYLQ9Y232 598 aa11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 NFIL3Q16649 462 aa11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 VCPIP1Q96JH7 1222 aa11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 CNDP1Q96KN2 507 aa11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 SERPINA4P29622 427 aa11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 FSTL1Q12841 308 aa11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 CREG2Q8IUH2 290 aa11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 TADA1Q96BN2 335 aa11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 DEPDC7Q96QD5 511 aa11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 VANGL2Q9ULK5 521 aa11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 AURKCQ9UQB9 309 aa11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa11.09□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP11.08□□□□□ -0.64
URB2-201ENST00000258243 SMARCB1Q12824 385 aa11.08□□□□□ -0.64
URB2-201ENST00000258243 SUN5Q8TC36 379 aa11.08□□□□□ -0.64
URB2-201ENST00000258243 FAM129BQ96TA1 746 aa11.08□□□□□ -0.64
URB2-201ENST00000258243 MYLK2Q9H1R3 596 aa11.08□□□□□ -0.64
URB2-201ENST00000258243 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
URB2-201ENST00000258243 COPG2Q9UBF2 871 aa11.08□□□□□ -0.64
URB2-201ENST00000258243 ZNF510Q9Y2H8 683 aa11.08□□□□□ -0.64
URB2-201ENST00000258243 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa11.08□□□□□ -0.64
URB2-201ENST00000258243 GJB1P08034 283 aa11.08□□□□□ -0.64
URB2-201ENST00000258243 FGFR1P11362 822 aa11.08□□□□□ -0.64
URB2-201ENST00000258243 TUSC3Q13454 348 aa11.08□□□□□ -0.64
URB2-201ENST00000258243 ATAT1Q5SQI0 421 aa11.08□□□□□ -0.64
URB2-201ENST00000258243 ARMC12Q5T9G4 340 aa11.08□□□□□ -0.64
URB2-201ENST00000258243 USP45Q70EL2 814 aa11.08□□□□□ -0.64
URB2-201ENST00000258243 C16orf62Q7Z3J2 963 aa11.08□□□□□ -0.64
URB2-201ENST00000258243 PRUNE1Q86TP1 453 aa11.08□□□□□ -0.64
URB2-201ENST00000258243 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms