RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253024.9

TRIM28-201, Transcript of tripartite motif containing 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM28, Length 2,960 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28-201ENST00000253024 EBF3Q9H4W6 596 aa21.81■■□□□ 1.08
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TRIM28-201ENST00000253024 DFFAO00273 331 aa21.8■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 NMBRP28336 390 aa21.8■■□□□ 1.08
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TRIM28-201ENST00000253024 SERPINB9P50453 376 aa21.8■■□□□ 1.08
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TRIM28-201ENST00000253024 OLFM3Q96PB7 478 aa21.8■■□□□ 1.08
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TRIM28-201ENST00000253024 TTC3P53804 2025 aa21.8■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 GPR32O75388 356 aa21.8■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
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TRIM28-201ENST00000253024 ZNF792Q3KQV3 632 aa21.8■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 RNF111Q6ZNA4 994 aa21.8■■□□□ 1.08
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TRIM28-201ENST00000253024 TASP1Q9H6P5 420 aa21.8■■□□□ 1.08
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TRIM28-201ENST00000253024 TMEM233B4DJY2 109 aa21.79■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 JUNP05412 331 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
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TRIM28-201ENST00000253024 GNAT1P11488 350 aa21.79■■□□□ 1.08
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TRIM28-201ENST00000253024 PTPN3P26045 913 aa21.79■■□□□ 1.08
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TRIM28-201ENST00000253024 CLEC20AQ6ZU45 233 aa21.79■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 FAM136AQ96C01 138 aa21.79■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 LRCH1Q9Y2L9 728 aa21.79■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 AP1G2O75843 785 aa21.79■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 SERPINE1P05121 402 aa21.79■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 PEX2P28328 305 aa21.79■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 ZBTB6Q15916 424 aa21.79■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 NOMO2Q5JPE7 1267 aa21.79■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 CCNYL1Q8N7R7 359 aa21.79■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 FAM156AQ8NDB6 213 aa21.79■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa21.79■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 SCOCQ9UIL1 159 aa21.79■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 BTBD19C9JJ37 291 aa21.78■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa21.78■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 CPOXP36551 454 aa21.78■■□□□ 1.08
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TRIM28-201ENST00000253024 DENND6AQ8IWF6 608 aa21.78■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa21.78■■□□□ 1.08
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TRIM28-201ENST00000253024 ACTR3P61158 418 aa21.78■■□□□ 1.08
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TRIM28-201ENST00000253024 CCL15Q16663 113 aa21.78■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 GRAMD1BQ3KR37 738 aa21.78■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 EFHC1Q5JVL4 640 aa21.78■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 FTHL17Q9BXU8 183 aa21.78■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 MORF4L1Q9UBU8 362 aa21.78■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 IPPQ9Y573 584 aa21.78■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 FYNP06241 537 aa21.78■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 NPR3P17342 541 aa21.78■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 GP5P40197 560 aa21.78■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 PDK1Q15118 436 aa21.78■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa21.78■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 FOXB2Q5VYV0 432 aa21.78■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 TSC22D3Q99576 134 aa21.78■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 GORASP1Q9BQQ3 440 aa21.78■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 DARSP14868 501 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 FDFT1P37268 417 aa21.77■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 MAGEA6P43360 314 aa21.77■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 CDC16Q13042 620 aa21.77■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 SNX17Q15036 470 aa21.77■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 TRIP10Q15642 601 aa21.77■■□□□ 1.08
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TRIM28-201ENST00000253024 GAD1Q99259 594 aa21.77■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa21.77■■□□□ 1.08
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TRIM28-201ENST00000253024 CD68P34810 354 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 NUDT2P50583 147 aa21.77■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 NAGLUP54802 743 aa21.77■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 SNAPC2Q13487 334 aa21.77■■□□□ 1.08
TRIM28-201ENST00000253024 ARHGAP17Q68EM7 881 aa21.77■■□□□ 1.08
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