RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pi16Q9ET66 489 aa17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trpm5Q9JJH7 1158 aa17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rpl9-ps1S4R1R7 191 aa17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ttc30a2A2AKQ8 664 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ttll11A4Q9F4 727 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Galntl6E5D8G1 601 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1354E9Q5G9 310 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ifi206G3UZV2 921 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dpysl2O08553 572 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Bub1O08901 1058 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Krt10P02535 570 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cdk7Q03147 346 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Eml1Q05BC3 814 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kcna4Q61423 654 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmem151aQ6GQT5 468 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Iars2Q8BIJ6 1012 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gtf3c4Q8BMQ2 817 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znf385bQ8BXJ8 482 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ero1bQ8R2E9 467 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 GsdmcQ99NB5 468 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q9D1Z2 194 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PapolbQ9WVP6 641 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pex11bQ9Z210 259 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Plxna1P70206 1894 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 LctF8VPT3 1931 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trdmt1O55055 415 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 InvsO89019 1062 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 JchainP01592 159 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kir3dl1P83555 432 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Caprin2Q05A80 1031 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmem26Q3UP23 366 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znf235Q61116 645 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 RetsatQ64FW2 609 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Scube1Q6NZL8 1018 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Chst10Q6PGK7 356 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc36a3Q811P0 477 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 LnpepQ8C129 1025 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Podxl2Q8CAE9 603 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nsmce2Q91VT1 247 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pcdha6Q91Y14 946 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vangl2Q91ZD4 521 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PdgfdQ925I7 370 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Unc45aQ99KD5 944 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam136aQ9CR98 138 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Serbp1Q9CY58 407 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mettl7bQ9DD20 244 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 LactbQ9EP89 551 aa17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mup13L7N222 235 aa17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cd3gP11942 182 aa17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc6a13P31649 602 aa17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 FynP39688 537 aa17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mpp1P70290 466 aa17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adamts1P97857 968 aa17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trafd1Q3UDK1 580 aa17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc22a16Q497L8 649 aa17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 9930111J21Rik1Q5SVP0 844 aa17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adgre1Q61549 931 aa17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Il17aQ62386 158 aa17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Xpo1Q6P5F9 1071 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dnajc16Q80TN4 772 aa17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc184Q8BMK5 191 aa17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Wwp1Q8BZZ3 918 aa17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Plbd1Q8VCI0 550 aa17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam114a2Q8VE88 497 aa17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam192aQ91WE2 254 aa17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 KlbQ99N32 1043 aa17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ProzQ9CQW3 399 aa17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pcna-ps2A0A140T8V5 261 aa17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp384E9Q1A5 584 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ercc2O08811 760 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dmp1O55188 503 aa17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ap2a1P17426 977 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PcnaP17918 261 aa17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Krt6aP50446 553 aa17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mettl17Q3U2U7 461 aa17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Btg1-ps1Q3V0S2 161 aa17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Btg1-ps2Q3V0X0 161 aa17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znf148Q61624 794 aa17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PostnQ62009 838 aa17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Arl13bQ640N2 427 aa17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Utp14bQ6EJB6 756 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Celf3Q8CIN6 465 aa17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pcdhb10Q91VE5 797 aa17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adcy4Q91WF3 1077 aa17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pdia5Q921X9 517 aa17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dock1Q8BUR4 1865 aa17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ttc3O88196 1979 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm281D3Z1Y0 860 aa17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dnmt3bO88509 859 aa17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mmp3P28862 477 aa17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ak8Q32M07 479 aa17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp956Q3UZY6 572 aa17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dnajb13Q80Y75 316 aa17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cwf19l2Q8BG79 887 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp398Q8BV16 643 aa17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 VcpkmtQ8C436 228 aa17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 4930519G04RikQ9CPT7 205 aa17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Raver1Q9CW46 748 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ttc30bQ9CY00 664 aa17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 GarsQ9CZD3 729 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.6 ms