RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, human

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA3B-215	ENST00000621029	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	41.32	■■■■■ 4.21
SEMA3B-215	ENST00000621029	ALS2	Q96Q42	1657 aa		41.32	■■■■■ 4.2
SEMA3B-215	ENST00000621029	FAM83G	A6ND36	823 aa		41.31	■■■■■ 4.2
SEMA3B-215	ENST00000621029	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		41.31	■■■■■ 4.2
SEMA3B-215	ENST00000621029	EVC2	Q86UK5	1308 aa		41.31	■■■■■ 4.2
SEMA3B-215	ENST00000621029	ABCA3	Q99758	1704 aa		41.3	■■■■■ 4.2
SEMA3B-215	ENST00000621029	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		41.29	■■■■■ 4.2
SEMA3B-215	ENST00000621029	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		41.29	■■■■■ 4.2
SEMA3B-215	ENST00000621029	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		41.29	■■■■■ 4.2
SEMA3B-215	ENST00000621029	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	41.29	■■■■■ 4.2
SEMA3B-215	ENST00000621029	CABP1	Q9NZU7	370 aa		41.25	■■■■■ 4.19
SEMA3B-215	ENST00000621029	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	41.23	■■■■■ 4.19
SEMA3B-215	ENST00000621029	ABTB2	Q8N961	1025 aa		41.22	■■■■■ 4.19
SEMA3B-215	ENST00000621029	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		41.21	■■■■■ 4.19
SEMA3B-215	ENST00000621029	VPS72	Q15906	364 aa		41.21	■■■■■ 4.19
SEMA3B-215	ENST00000621029	BTG4	Q9NY30	223 aa		41.21	■■■■■ 4.19
SEMA3B-215	ENST00000621029	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		41.2	■■■■■ 4.19
SEMA3B-215	ENST00000621029	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		41.19	■■■■■ 4.18
SEMA3B-215	ENST00000621029	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		41.18	■■■■■ 4.18
SEMA3B-215	ENST00000621029	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		41.14	■■■■■ 4.18
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	41.13	■■■■■ 4.17
SEMA3B-215	ENST00000621029	GLI3	P10071	1580 aa		41.12	■■■■■ 4.17
SEMA3B-215	ENST00000621029	KIAA0232	Q92628	1395 aa		41.11	■■■■■ 4.17
SEMA3B-215	ENST00000621029	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	41.1	■■■■■ 4.17
SEMA3B-215	ENST00000621029	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		41.1	■■■■■ 4.17
SEMA3B-215	ENST00000621029	CHRNA2	Q15822	529 aa		41.09	■■■■■ 4.17
SEMA3B-215	ENST00000621029	NLRP13	Q86W25	1043 aa		41.09	■■■■■ 4.17
SEMA3B-215	ENST00000621029		A0A0G2JS52	829 aa		41.08	■■■■■ 4.17
SEMA3B-215	ENST00000621029	MYT1	Q01538	1121 aa		41.08	■■■■■ 4.17
SEMA3B-215	ENST00000621029	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		41.07	■■■■■ 4.17
SEMA3B-215	ENST00000621029	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		41.07	■■■■■ 4.17
SEMA3B-215	ENST00000621029	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	41.07	■■■■■ 4.16
SEMA3B-215	ENST00000621029	USP6	P35125	1406 aa		41.06	■■■■■ 4.16
SEMA3B-215	ENST00000621029	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	41.03	■■■■■ 4.16
SEMA3B-215	ENST00000621029	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		41.01	■■■■■ 4.16
SEMA3B-215	ENST00000621029	NLRP6	P59044	892 aa		41.01	■■■■■ 4.16
SEMA3B-215	ENST00000621029	STRN4	Q9NRL3	753 aa		41.01	■■■■■ 4.16
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	41	■■■■■ 4.15
SEMA3B-215	ENST00000621029	USP19	O94966	1318 aa		40.99	■■■■■ 4.15
SEMA3B-215	ENST00000621029	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	40.99	■■■■■ 4.15
SEMA3B-215	ENST00000621029	NRAP	Q86VF7	1730 aa		40.98	■■■■■ 4.15
SEMA3B-215	ENST00000621029	GC	P02774	474 aa		40.97	■■■■■ 4.15
SEMA3B-215	ENST00000621029	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	40.96	■■■■■ 4.15
SEMA3B-215	ENST00000621029	EVA1C	P58658	441 aa		40.96	■■■■■ 4.15
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		40.95	■■■■■ 4.15
SEMA3B-215	ENST00000621029	TMC1	Q8TDI8	760 aa		40.95	■■■■■ 4.15
SEMA3B-215	ENST00000621029	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		40.93	■■■■■ 4.14
SEMA3B-215	ENST00000621029	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		40.93	■■■■■ 4.14
SEMA3B-215	ENST00000621029	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		40.92	■■■■■ 4.14
SEMA3B-215	ENST00000621029	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	40.91	■■■■■ 4.14
SEMA3B-215	ENST00000621029	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		40.91	■■■■■ 4.14
SEMA3B-215	ENST00000621029	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		40.91	■■■■■ 4.14
SEMA3B-215	ENST00000621029	CPD	O75976	1380 aa		40.89	■■■■■ 4.14
SEMA3B-215	ENST00000621029	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		40.89	■■■■■ 4.14
SEMA3B-215	ENST00000621029	SSH2	Q76I76	1423 aa		40.89	■■■■■ 4.14
SEMA3B-215	ENST00000621029	CCDC125	Q86Z20	511 aa		40.87	■■■■■ 4.13
SEMA3B-215	ENST00000621029	USP35	Q9P2H5	1018 aa		40.85	■■■■■ 4.13
SEMA3B-215	ENST00000621029	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		40.85	■■■■■ 4.13
SEMA3B-215	ENST00000621029	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	40.84	■■■■■ 4.13
SEMA3B-215	ENST00000621029	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		40.84	■■■■■ 4.13
SEMA3B-215	ENST00000621029	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		40.83	■■■■■ 4.13
SEMA3B-215	ENST00000621029	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	40.82	■■■■■ 4.13
SEMA3B-215	ENST00000621029	SOX12	O15370	315 aa		40.81	■■■■■ 4.12
SEMA3B-215	ENST00000621029	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	40.81	■■■■■ 4.12
SEMA3B-215	ENST00000621029	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		40.81	■■■■■ 4.12
SEMA3B-215	ENST00000621029	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		40.81	■■■■■ 4.12
SEMA3B-215	ENST00000621029	AKAP12	Q02952	1782 aa		40.79	■■■■■ 4.12
SEMA3B-215	ENST00000621029	PIK3C2A	O00443	1686 aa		40.79	■■■■■ 4.12
SEMA3B-215	ENST00000621029	SLC24A1	O60721	1099 aa		40.79	■■■■■ 4.12
SEMA3B-215	ENST00000621029	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		40.78	■■■■■ 4.12
SEMA3B-215	ENST00000621029	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	40.78	■■■■■ 4.12
SEMA3B-215	ENST00000621029	TESK2	Q96S53	571 aa		40.78	■■■■■ 4.12
SEMA3B-215	ENST00000621029	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		40.78	■■■■■ 4.12
SEMA3B-215	ENST00000621029	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	40.77	■■■■■ 4.12
SEMA3B-215	ENST00000621029	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		40.77	■■■■■ 4.12
SEMA3B-215	ENST00000621029	SLIT3	O75094	1523 aa		40.77	■■■■■ 4.12
SEMA3B-215	ENST00000621029	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		40.76	■■■■■ 4.12
SEMA3B-215	ENST00000621029	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	40.76	■■■■■ 4.12
SEMA3B-215	ENST00000621029	EP400	Q96L91	3159 aa		40.76	■■■■■ 4.12
SEMA3B-215	ENST00000621029	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	40.74	■■■■■ 4.11
SEMA3B-215	ENST00000621029	USP47	Q96K76	1375 aa		40.74	■■■■■ 4.11
SEMA3B-215	ENST00000621029	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	40.73	■■■■■ 4.11
SEMA3B-215	ENST00000621029	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		40.71	■■■■■ 4.11
SEMA3B-215	ENST00000621029	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		40.71	■■■■■ 4.11
SEMA3B-215	ENST00000621029	FAM182B	Q5T319	152 aa		40.69	■■■■■ 4.1
SEMA3B-215	ENST00000621029	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		40.69	■■■■■ 4.1
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		40.69	■■■■■ 4.1
SEMA3B-215	ENST00000621029	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		40.69	■■■■■ 4.1
SEMA3B-215	ENST00000621029	NME9	Q86XW9	330 aa		40.68	■■■■■ 4.1
SEMA3B-215	ENST00000621029	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	40.67	■■■■■ 4.1
SEMA3B-215	ENST00000621029	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		40.67	■■■■■ 4.1
SEMA3B-215	ENST00000621029	TMF1	P82094	1093 aa		40.66	■■■■■ 4.1
SEMA3B-215	ENST00000621029	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		40.65	■■■■■ 4.1
SEMA3B-215	ENST00000621029		A0A1W2PP64	1363 aa		40.64	■■■■■ 4.1
SEMA3B-215	ENST00000621029	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		40.64	■■■■■ 4.1
SEMA3B-215	ENST00000621029	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		40.64	■■■■■ 4.1
SEMA3B-215	ENST00000621029	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	40.62	■■■■■ 4.09
SEMA3B-215	ENST00000621029	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		40.62	■■■■■ 4.09
SEMA3B-215	ENST00000621029	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		40.61	■■■■■ 4.09
SEMA3B-215	ENST00000621029	PDE3B	Q13370	1112 aa		40.61	■■■■■ 4.09

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