RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-215ENST00000621029 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.21
SEMA3B-215ENST00000621029 ALS2Q96Q42 1657 aa41.32■■■■■ 4.2
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM83GA6ND36 823 aa41.31■■■■■ 4.2
SEMA3B-215ENST00000621029 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa41.31■■■■■ 4.2
SEMA3B-215ENST00000621029 EVC2Q86UK5 1308 aa41.31■■■■■ 4.2
SEMA3B-215ENST00000621029 ABCA3Q99758 1704 aa41.3■■■■■ 4.2
SEMA3B-215ENST00000621029 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa41.29■■■■■ 4.2
SEMA3B-215ENST00000621029 NUTM2GQ5VZR2 741 aa41.29■■■■■ 4.2
SEMA3B-215ENST00000621029 CARD11Q9BXL7 1154 aa41.29■■■■■ 4.2
SEMA3B-215ENST00000621029 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP41.29■■■■■ 4.2
SEMA3B-215ENST00000621029 CABP1Q9NZU7 370 aa41.25■■■■■ 4.19
SEMA3B-215ENST00000621029 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
SEMA3B-215ENST00000621029 ABTB2Q8N961 1025 aa41.22■■■■■ 4.19
SEMA3B-215ENST00000621029 RALGAPBQ86X10 1494 aa41.21■■■■■ 4.19
SEMA3B-215ENST00000621029 VPS72Q15906 364 aa41.21■■■■■ 4.19
SEMA3B-215ENST00000621029 BTG4Q9NY30 223 aa41.21■■■■■ 4.19
SEMA3B-215ENST00000621029 PRDM11Q9NQV5 511 aa41.2■■■■■ 4.19
SEMA3B-215ENST00000621029 PLCH1Q4KWH8 1693 aa41.19■■■■■ 4.18
SEMA3B-215ENST00000621029 ATAD2Q6PL18 1390 aa41.18■■■■■ 4.18
SEMA3B-215ENST00000621029 NWD2Q9ULI1 1742 aa41.14■■■■■ 4.18
SEMA3B-215ENST00000621029 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.17
SEMA3B-215ENST00000621029 GLI3P10071 1580 aa41.12■■■■■ 4.17
SEMA3B-215ENST00000621029 KIAA0232Q92628 1395 aa41.11■■■■■ 4.17
SEMA3B-215ENST00000621029 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
SEMA3B-215ENST00000621029 PCGF6Q9BYE7 350 aa41.1■■■■■ 4.17
SEMA3B-215ENST00000621029 CHRNA2Q15822 529 aa41.09■■■■■ 4.17
SEMA3B-215ENST00000621029 NLRP13Q86W25 1043 aa41.09■■■■■ 4.17
SEMA3B-215ENST00000621029 A0A0G2JS52 829 aa41.08■■■■■ 4.17
SEMA3B-215ENST00000621029 MYT1Q01538 1121 aa41.08■■■■■ 4.17
SEMA3B-215ENST00000621029 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa41.07■■■■■ 4.17
SEMA3B-215ENST00000621029 SEPT12Q8IYM1 358 aa41.07■■■■■ 4.17
SEMA3B-215ENST00000621029 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP41.07■■■■■ 4.16
SEMA3B-215ENST00000621029 USP6P35125 1406 aa41.06■■■■■ 4.16
SEMA3B-215ENST00000621029 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
SEMA3B-215ENST00000621029 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa41.01■■■■■ 4.16
SEMA3B-215ENST00000621029 NLRP6P59044 892 aa41.01■■■■■ 4.16
SEMA3B-215ENST00000621029 STRN4Q9NRL3 753 aa41.01■■■■■ 4.16
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP41■■■■■ 4.15
SEMA3B-215ENST00000621029 USP19O94966 1318 aa40.99■■■■■ 4.15
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
SEMA3B-215ENST00000621029 NRAPQ86VF7 1730 aa40.98■■■■■ 4.15
SEMA3B-215ENST00000621029 GCP02774 474 aa40.97■■■■■ 4.15
SEMA3B-215ENST00000621029 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP40.96■■■■■ 4.15
SEMA3B-215ENST00000621029 EVA1CP58658 441 aa40.96■■■■■ 4.15
SEMA3B-215ENST00000621029 ZBTB7CA1YPR0 619 aa40.95■■■■■ 4.15
SEMA3B-215ENST00000621029 TMC1Q8TDI8 760 aa40.95■■■■■ 4.15
SEMA3B-215ENST00000621029 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa40.93■■■■■ 4.14
SEMA3B-215ENST00000621029 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa40.93■■■■■ 4.14
SEMA3B-215ENST00000621029 NRKQ7Z2Y5 1582 aa40.92■■■■■ 4.14
SEMA3B-215ENST00000621029 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP40.91■■■■■ 4.14
SEMA3B-215ENST00000621029 KRT27Q7Z3Y8 459 aa40.91■■■■■ 4.14
SEMA3B-215ENST00000621029 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa40.91■■■■■ 4.14
SEMA3B-215ENST00000621029 CPDO75976 1380 aa40.89■■■■■ 4.14
SEMA3B-215ENST00000621029 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa40.89■■■■■ 4.14
SEMA3B-215ENST00000621029 SSH2Q76I76 1423 aa40.89■■■■■ 4.14
SEMA3B-215ENST00000621029 CCDC125Q86Z20 511 aa40.87■■■■■ 4.13
SEMA3B-215ENST00000621029 USP35Q9P2H5 1018 aa40.85■■■■■ 4.13
SEMA3B-215ENST00000621029 TTC21AQ8NDW8 1320 aa40.85■■■■■ 4.13
SEMA3B-215ENST00000621029 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
SEMA3B-215ENST00000621029 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa40.84■■■■■ 4.13
SEMA3B-215ENST00000621029 BRWD3Q6RI45 1802 aa40.83■■■■■ 4.13
SEMA3B-215ENST00000621029 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP40.82■■■■■ 4.13
SEMA3B-215ENST00000621029 SOX12O15370 315 aa40.81■■■■■ 4.12
SEMA3B-215ENST00000621029 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP40.81■■■■■ 4.12
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa40.81■■■■■ 4.12
SEMA3B-215ENST00000621029 CLSPNQ9HAW4 1339 aa40.81■■■■■ 4.12
SEMA3B-215ENST00000621029 AKAP12Q02952 1782 aa40.79■■■■■ 4.12
SEMA3B-215ENST00000621029 PIK3C2AO00443 1686 aa40.79■■■■■ 4.12
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC24A1O60721 1099 aa40.79■■■■■ 4.12
SEMA3B-215ENST00000621029 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa40.78■■■■■ 4.12
SEMA3B-215ENST00000621029 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP40.78■■■■■ 4.12
SEMA3B-215ENST00000621029 TESK2Q96S53 571 aa40.78■■■■■ 4.12
SEMA3B-215ENST00000621029 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa40.78■■■■■ 4.12
SEMA3B-215ENST00000621029 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP40.77■■■■■ 4.12
SEMA3B-215ENST00000621029 TERF2IPQ9NYB0 399 aa40.77■■■■■ 4.12
SEMA3B-215ENST00000621029 SLIT3O75094 1523 aa40.77■■■■■ 4.12
SEMA3B-215ENST00000621029 KCNH5Q8NCM2 988 aa40.76■■■■■ 4.12
SEMA3B-215ENST00000621029 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
SEMA3B-215ENST00000621029 EP400Q96L91 3159 aa40.76■■■■■ 4.12
SEMA3B-215ENST00000621029 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP40.74■■■■■ 4.11
SEMA3B-215ENST00000621029 USP47Q96K76 1375 aa40.74■■■■■ 4.11
SEMA3B-215ENST00000621029 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP40.73■■■■■ 4.11
SEMA3B-215ENST00000621029 LMO7Q8WWI1 1683 aa40.71■■■■■ 4.11
SEMA3B-215ENST00000621029 AATKQ6ZMQ8 1374 aa40.71■■■■■ 4.11
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM182BQ5T319 152 aa40.69■■■■■ 4.1
SEMA3B-215ENST00000621029 TCP11L2Q8N4U5 519 aa40.69■■■■■ 4.1
SEMA3B-215ENST00000621029 ZRANB1Q9UGI0 708 aa40.69■■■■■ 4.1
SEMA3B-215ENST00000621029 CD163L1Q9NR16 1453 aa40.69■■■■■ 4.1
SEMA3B-215ENST00000621029 NME9Q86XW9 330 aa40.68■■■■■ 4.1
SEMA3B-215ENST00000621029 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
SEMA3B-215ENST00000621029 MON2Q7Z3U7 1717 aa40.67■■■■■ 4.1
SEMA3B-215ENST00000621029 TMF1P82094 1093 aa40.66■■■■■ 4.1
SEMA3B-215ENST00000621029 BARGINQ6ZT62 677 aa40.65■■■■■ 4.1
SEMA3B-215ENST00000621029 A0A1W2PP64 1363 aa40.64■■■■■ 4.1
SEMA3B-215ENST00000621029 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa40.64■■■■■ 4.1
SEMA3B-215ENST00000621029 ARHGEF25Q86VW2 580 aa40.64■■■■■ 4.1
SEMA3B-215ENST00000621029 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP40.62■■■■■ 4.09
SEMA3B-215ENST00000621029 DEFB132Q7Z7B7 95 aa40.62■■■■■ 4.09
SEMA3B-215ENST00000621029 NINLQ9Y2I6 1382 aa40.61■■■■■ 4.09
SEMA3B-215ENST00000621029 PDE3BQ13370 1112 aa40.61■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 144.7 ms